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实蝇科果实蝇族（Dacini）在全球范围内属于经济危害最为严重的农业害虫之一，其中若干果实蝇属（Bactrocera Macquart）和寡鬃实蝇属（Zeugodacus Hendel）物种可导致南亚和东南亚水果及蔬菜生产遭受严重损失。孟加拉国境内具有重要农业意义的果实蝇族物种有5种：东方果实蝇 Bactrocera dorsalis（Hendel）、杨桃果实蝇 B. carambolae Drew & Hancock、桃实蝇 B. zonata（Saunders）、辣椒果实蝇 B. correcta（Bezzi）以及瓜实蝇 Zeugodacus cucurbitae（Coquillett）。本文基于从美国国家生物技术信息中心（NCBI）GenBank数据库获取的21条独特线粒体基因组记录，构建了一个比较线粒体基因组学与分子系统发育学框架，其中包括19个果实蝇族内群分类单元和2个外群。对GenBank序列的直接解析证实，全部21条记录均具有典型的13个蛋白质编码基因（PCGs）和2个核糖体RNA基因。14个果实蝇属内群分类单元的基因组大小范围为15,273—15,977 bp。全基因组AT含量从桔小实蝇 Bactrocera tsuneonis 的66.6%到黑腹果蝇 Drosophila melanogaster 的82.2%不等；与孟加拉国相关的5种果实蝇族害虫的AT含量则高度集中在72.9%—73.6%之间。基于13,600个核苷酸位点（13个PCGs + 12S + 16S rRNA）的拼接序列比对，在GTR+FO模型下进行了最大似然分析（IQ-TREE v1.6.11；1,000次超快速自助法重复）。最大似然树恢复了东方果实蝇复合种群（UFBoot = 79—100），并将辣椒果实蝇 B. correcta 与桃实蝇 B. zonata 置于一个获得最大支持的姐妹群中（UFBoot = 100）。本研究为孟加拉国的分子鉴定与害虫监测提供了经序列验证的线粒体基因组参考框架；鉴于本研究未对新采集的孟加拉国标本进行测序，其结果应被视为经过整理的比较基线，而非群体基因组学分析。
实蝇科（Tephritidae）果实蝇族（Dacini）是全球危害最为严重、具有重要经济影响的农业害虫类群之一，其中多个桔小实蝇属（Bactrocera Macquart）和瓜实蝇属（Zeugodacus Hendel）物种在南亚和东南亚造成了水果及蔬菜生产的严重损失。孟加拉国境内有5种具有重要农业意义的果实蝇：桔小实蝇（Bactrocera dorsalis (Hendel)）、杨桃实蝇（B. carambolae Drew & Hancock）、橘小实蝇（B. zonata (Saunders)）、柑橘小实蝇（B. correcta (Bezzi)）以及瓜实蝇（Zeugodacus cucurbitae (Coquillett)）。本文基于从NCBI GenBank检索获得的21条独特线粒体基因组记录，构建了一个比较线粒体基因组学与分子系统发育分析框架，其中包括19个果实蝇族内类群和2个外群。对GenBank序列进行直接解析证实，全部21条记录均具有典型的13个蛋白质编码基因（PCGs）和2个核糖体RNA基因。在14个桔小实蝇属内群类群中，基因组大小介于15,273至15,977 bp之间。全基因组AT含量范围为66.6%（桔小实蝇属Bactrocera tsuneonis）至82.2%（黑腹果蝇Drosophila melanogaster）；与孟加拉国相关的5种果实蝇害虫的AT含量高度集中在72.9%—73.6%之间。基于13,600个核苷酸位点（13个PCGs + 12S + 16S rRNA）的拼接序列比对，在GTR+FO模型下采用最大似然法进行分析（IQ-TREE v1.6.11；1,000次超快速自助法重复）。最大似然树恢复了桔小实蝇复合群（B. dorsalis complex；UFBoot = 79—100），并将柑橘小实蝇B. correcta与橘小实蝇B. zonata置于一个获得最大支持度的姐妹群中（UFBoot = 100）。本研究为孟加拉国的分子鉴定和害虫监测提供了经序列验证的线粒体基因组参考框架；但由于未对新采集的孟加拉国标本进行测序，因此本研究应被视为经过整理的比较基线，而非群体基因组学分析。
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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.12.751165v1?rss=1
🏷️ 线粒体基因组学 分子系统发育 果实蝇害虫 分子鉴定 比较基因组学