埃及首次检出与迁徙野鸟相关的高致病性禽流感病毒A(H5N1) 2.3.4.4b分支EA-2024-DI.2.1基因型

由 root 提交于 周六, 09/19/2026 - 08:47
高致病性禽流感(HPAI)H5 2.3.4.4b 支系是当前史无前例的全球性泛动物疫情持续发展的主要驱动因素。近期出现的高致病性禽流感 H5N1 2.3.4.4b 支系 EA-2024-DI.2.1 基因型已在欧洲占据优势地位,迁徙性野生鸟类,尤其是水禽,在其传播过程中发挥了重要作用。埃及位于主要的亚欧—非洲迁徙通道沿线,而这些迁徙通道历来在新出现的 H5Nx 病毒传入该国的过程中发挥重要作用。本研究针对在埃及北部活禽市场(LBMs)和路边交易点出售的 416 只野生鸟类开展了重点监测,采样地点主要位于达米埃塔省和塞得港省。其中,对 118 只表现出轻微临床症状的鸟类进行剖检,并采集肺脏和气管组织;对于表观健康的鸟类,则采集口咽拭子和泄殖腔拭子。通过 RT-qPCR 在 22 只野生鸟类中检测到禽流感病毒,且全部来自组织样本;而所有表观健康鸟类的拭子样本检测结果均为阴性。22 只阳性鸟类中,水禽占 16 只(72.7%),其中欧亚鸻的 Ct 值最低(21~25)。系统发育分析和全基因组分析显示,测序获得的野生鸟类病毒均聚类于近期出现的 EA-2024-DI.2.1 亚系,并且与欧洲同期流行的病毒具有密切亲缘关系。与目前在埃及家禽中流行的 EA-2021-AB 基因型相比,EA-2024-DI.2.1 病毒的 HA 蛋白存在多个氨基酸差异,包括 A83D、L104M 和 T195A。这些发现为迁徙性野生鸟类将 EA-2024-DI.2.1 引入埃及提供了证据,并凸显了在野生鸟类与家禽交界面持续开展基因组监测,以及针对埃及目前使用的疫苗进行抗原性评估的重要性。

高致病性禽流感(HPAI)H5亚型2.3.4.4b分支是当前空前全球泛兽疫持续蔓延的主要驱动因素。近期出现的HPAI H5N1亚型2.3.4.4b分支EA-2024-DI.2.1基因型已在欧洲占据优势,其中迁徙性野鸟,尤其是水禽,在其传播过程中发挥了重要作用。埃及位于主要的亚欧—非洲迁徙通道沿线,这些迁徙通道在历史上一直对新出现的H5Nx病毒传入埃及发挥重要作用。本研究针对在埃及北部活禽市场(LBMs)和路边交易点出售的416只野鸟开展了监测,采样地点主要位于杜姆亚特省和塞得港。上述鸟类中,有118只表现出轻微临床症状,接受了剖检并采集肺组织和气管组织;对于表观健康的鸟类,则采集了口咽拭子和泄殖腔拭子。通过RT-qPCR在22只野鸟中检测到禽流感病毒,且均来自组织样本;而所有表观健康鸟类的拭子样本均为阴性。22只阳性鸟类中,水禽占16只(72.7%),其中绿头鸭的亚种绿翅鸭(Eurasian teal)显示出最低的Ct值(21–25)。系统发育分析和全基因组分析显示,完成测序的野鸟来源病毒均聚集于近期出现的EA-2024-DI.2.1亚支系内,并且与同期欧洲病毒株具有密切亲缘关系。与目前在埃及家禽中流行的EA-2021-AB基因型相比,EA-2024-DI.2.1病毒在HA蛋白氨基酸序列上存在若干差异,包括A83D、L104M和T195A。这些发现为迁徙性野鸟将EA-2024-DI.2.1引入埃及提供了证据,并凸显了在野鸟—家禽界面持续开展基因组监测,以及针对埃及当前使用疫苗进行抗原性评估的重要性。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.12.750890v1?rss=1

🏷️ 高致病性禽流感病毒 H5N1 迁徙野生鸟类 系统发育分析 全基因组监测 EA-2024-DI.2.1基因型