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摘要： 背景：膳食干预可调节肠道微生物群落的组成。然而，这些变化的一致性和幅度在个体之间可能存在差异。越来越多的证据表明，这种变异受到基线微生物组成和宿主特征的影响，而饮食、生活方式及环境暴露的差异也可能进一步导致这种异质性。共同居住环境为参与者在同一地点共同生活并摄入标准化饮食提供了条件，有助于最大限度地减少由这些外部因素所导致的变异，并探究影响微生物组组成及其对饮食反应的因素。在本研究中，我们对共同居住条件下一个多民族队列的基线肠道微生物组成决定因素进行了表征，并评估了其对短期肠道友好型膳食干预的响应。 方法：来自印度北部、印度南部及国际背景的43名成年人以单臂设计共同居住于一个“临时村落”中，为期15天。参与者遵循肠道友好型膳食方案。根据体重指数（BMI），参与者被分为超重/肥胖组（OW，≥25）和非超重组（Non-OW，摘要：
背景：膳食干预可调节肠道微生物群落的组成。然而，这些变化的一致性和幅度可能因个体而异。越来越多的证据表明，这种差异受到基线微生物组成和宿主特征的影响，而饮食、生活方式及环境暴露的差异还可能进一步加剧这种异质性。共享居住环境为参与者在同一地点共同居住并摄入标准化饮食提供了条件，有助于最大限度地减少这些外部因素所导致的变异，并探究微生物组组成及其对膳食反应的影响因素。本研究在共享居住条件下的多民族队列中，刻画了基线肠道微生物组成的决定因素，并评估了短期肠道友好型膳食干预所引发的响应。
方法：来自印度北部、印度南部及国际背景的43名成年人以单臂设计在一个“快闪村”中共同生活15天。参与者遵循肠道友好型膳食方案。根据体重指数（BMI），参与者被分为超重/肥胖组（OW，≥25）和非超重组（Non-OW，
结果：基线时，地理区域（p = 0.046）和BMI（p = 0.024）是影响群落组成的主要因素，而习惯性饮食类型并非主要影响因素（p = 0.792）。干预产生了幅度较小但高度可重复的变化，在五种距离度量中均达到统计学显著性（p ≤ 0.003）。超重组（OW）参与者的响应更强，表现出显著变化（p = 0.001），而非超重组（Non-OW）参与者未观察到显著变化（p = 0.181）。时间点与BMI的交互作用在Bray-Curtis距离（p = 0.021）和Aitchison距离（p = 0.028）中均具有统计学显著性。全队列差异丰度分析显示，与口腔相关的物种副血链球菌（Streptococcus parasanguinis，q = 0.010）和血液小球菌（Gemella sanguinis，q = 0.021）丰度降低，同时有六个属呈现差异丰度，其中放线菌属（Actinomyces）丰度降低（q = 0.004），粪杆菌属（Faecalibacterium）丰度升高（q = 0.016）。在全队列水平上，六条主要代谢通路的功能群落组成总体保持稳定。
结论：短期、共享环境下的肠道友好型膳食可引发肠道微生物组组成幅度适中但具有协调性的变化，其特征表现为若干与口腔相关的条件致病菌类群减少，以及纤维发酵类群富集；群落水平的组成变化主要见于超重参与者。
关键词：肠道微生物组；膳食干预；鸟枪法宏基因组学；快闪村研究。
D.P. 是 Cartema Bio 及 Centenarians Life Sciences Pvt. Ltd.（印度）的创始人兼首席科学官；该公司提供了微生物组检测套件并资助了样本分析。J.L.、S.U. 和 A.M. 任职于 Cartema Bio。O.M. 任职于美国纽约州纽约市的 Thorne，并担任 Cartema Bio 的科学顾问。
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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.16.751977v1?rss=1
🏷️ 肠道微生物组 膳食干预 宏基因组学 多民族队列 BMI与微生物组响应