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利用长读长测序，我们在叶蜂物种 Euura vittata 中发现了一个 NUMT（线粒体来源的核片段），其中包含完整的编码区，且所有基因的排列顺序均与线粒体中的相同。该 NUMT 与线粒体序列存在 3.2% 的差异（COI 条形码区域的分化率为 4.1%），但在采用线粒体遗传密码的前提下，其整体上似乎仍具有功能。对全基因组组装中包含该 NUMT 的重叠群进行检查后，未发现组装问题；同时，其测序覆盖深度符合单拷贝核基因的预期，这有力地表明该序列是整合到细胞核中的，而非异质性现象。基于线粒体 COI 数据，该 NUMT 与一个序列簇最为相似，该序列簇主要包含 Euura tillbergi 及其近缘物种的序列（但也包含少数 E. vittata 个体的序列）。因此，该 NUMT 可能源于近期的线粒体渐渗，这可以解释其分化程度及其表现出的功能性。由此可见，对于分化的异质性现象的报道，应通过长读长测序或 RNA 测序，或其他适当的实验加以验证。
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利用长读长测序，我们在锯蜂物种 Euura vittata 中发现了一个 NUMT（源自线粒体的核片段），其中包含完整的编码区，且所有基因的排列顺序与线粒体中的相同。该 NUMT 与线粒体序列相差 3.2%（COI 条形码区域的分化程度为 4.1%），但在采用线粒体遗传密码的前提下，其整体上似乎具有功能。对含有该 NUMT 的全基因组组装重叠群进行检查后，未发现组装问题；其测序覆盖深度也符合单拷贝核基因的预期，这有力地表明该序列是整合到核基因组中的，而非源于异质性。基于线粒体 COI 数据，该 NUMT 与一个主要包含 Euura tillbergi 及其近缘物种序列的聚类最为相似（其中也包括少数 E. vittata 个体）。因此，该 NUMT 可能源于近期的线粒体渗入，从而解释了其分化程度及其看似具有功能的特征。其意义在于，关于高分化异质性的报道需要通过长读长测序或 RNA 测序，或其他适当的实验加以验证。
利益冲突声明
基金资助信息声明
爱沙尼亚研究委员会 ，STP42
Kvantum 研究所
奥卢大学生物多样性人类世研究规划项目
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发布于 2026 年 9 月 18 日。
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《模拟完整且具有功能的线粒体基因组的分化型超大型 NUMT》
Marko Prous
bioRxiv
2026.09.18.752603； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.18.752603
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《模拟完整且具有功能的线粒体基因组的分化型超大型 NUMT》
Marko Prous
bioRxiv
2026.09.18.752603； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.18.752603
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.18.752603v1?rss=1
🏷️ NUMT 线粒体基因组 核基因组整合 长读长测序 线粒体渐渗