宿主来源和病毒来源的插入序列对原代人肝细胞抗病毒反应的影响

由 root 提交于 周五, 09/18/2026 - 04:47
尽管全球范围内丙型肝炎病毒(HEV)感染负担沉重,但目前对于参与HEV发病机制及其进展为慢性感染的宿主—病毒相互作用,仍缺乏充分认识。本研究旨在表征感染携带高变区(HVR)内不同宿主来源和病毒来源插入序列的HEV变异株后宿主的转录组应答,重点关注先天免疫激活。我们对来自3名供体、感染了体内鉴定的携带不同HVR插入序列(RPS17、HVR重复序列、SERPINA1和TRIM22)的HEV-3变异株的原代人肝细胞(PHHs)进行了整体RNA测序。为比较不同变异株的复制适应性,我们定量检测了子代病毒滴度以及细胞转录组中的病毒RNA读段。我们在多个时间点对宿主转录组应答进行了详细分析,以评估病毒诱导的差异基因表达。为进一步表征不同HVR插入变异株感染HEV后引发的应答,我们开展了基因本体分析,并鉴定了单个HEV诱导基因。 感染后72小时(h p.i.)的子代病毒滴度在所有PHH供体及HVR插入变异株之间均具有可比性。其中两名供体对HEV感染产生了强烈的宿主应答,其特征为感染后72小时广泛的基因失调以及干扰素刺激基因(ISG)的上调。与RPS17、SERPINA1和TRIM22变异株相比,HVR重复序列插入变异株持续诱导较弱的宿主应答,表现为差异表达基因显著减少以及ISG诱导水平降低。基因本体术语分析显示,感染不同插入变异株后抗病毒通路均出现富集,但HVR重复序列变异株所引发的富集程度较低。 这些发现表明,HEV HVR重排变异株可诱导不同模式的宿主应答。值得注意的是,我们的结果提示病毒复制与宿主应答诱导之间存在正相关关系。这表明,HVR可能在塑造宿主—病毒相互作用方面发挥关键作用。

尽管全球范围内乙型肝炎病毒(HEV)感染负担沉重,但目前对于介导HEV发病机制及其向慢性感染进展的宿主-病毒相互作用仍缺乏充分认识。本研究旨在表征感染携带高变区(HVR)中不同宿主来源和病毒来源插入序列的HEV变异株后宿主的转录组反应,重点关注先天免疫激活。我们对来自3名供体、感染了体内鉴定的携带不同HVR插入序列(RPS17、HVR重复、SERPINA1和TRIM22)的HEV-3变异株的原代人肝细胞(PHHs)进行了整体RNA测序。为比较这些变异株的复制适应性,我们定量检测了子代病毒滴度及细胞转录组中的病毒RNA测序读段。在多个时间点对宿主转录组反应进行了详细分析,以评估病毒诱导的差异基因表达。为进一步表征不同HVR插入变异株感染HEV后的反应,我们开展了基因本体分析,并鉴定了个别HEV诱导基因。感染后72小时(h p.i.),所有PHH供体及HVR插入变异株的子代病毒滴度均相近。其中两名供体对HEV感染产生了强烈的宿主反应,其特征表现为感染后72小时广泛的基因表达失调及干扰素刺激基因(ISG)的上调。与RPS17、SERPINA1和TRIM22变异株相比,HVR重复插入变异株始终诱导较弱的宿主反应,表现为差异表达基因显著减少以及ISG诱导水平降低。基因本体术语分析显示,感染不同插入变异株后抗病毒通路均得到富集,但HVR重复变异株所引起的富集程度较低。这些发现表明,HEV HVR重排变异株可诱导不同的宿主反应模式。重要的是,我们的结果提示病毒复制与宿主反应诱导之间存在正相关。这表明,HVR可能在塑造宿主-病毒相互作用方面发挥关键作用。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.15.750637v1?rss=1

🏷️ 丙型肝炎病毒 高变区插入序列 原代人肝细胞 先天免疫反应 转录组应答