溶组织阿米巴核孔复合体的进化多样化揭示了保守型和谱系特异性核孔蛋白

核孔复合体（nuclear pore complexes，NPCs）是细胞核与细胞质之间进行大分子交换的门户。尽管NPC的结构在真核生物中总体上具有较高的保守性，但其在不同谱系中仍发生了显著的特异性多样化，尤其是在演化上高度分化的原生生物中更为明显。在本研究中，我们考察了溶组织内阿米巴（Entamoeba histolytica）的NPC。溶组织内阿米巴是一种演化上高度分化的变形虫类生物，也是阿米巴病的病原体。我们以含FG重复序列的核孔蛋白EhNup98-like为诱饵，结合亲和纯化与质谱分析，鉴定出多种相关蛋白，其中包括一种此前未被表征、且与Nup53/Nup35具有相似性的候选核孔蛋白。对EhNup53-like开展的互补蛋白质组学分析进一步鉴定出更为广泛的候选NPC组分，包括与保守核孔蛋白相对应的蛋白，以及若干此前未被表征的核孔相关蛋白。结构分析表明，尽管该EhNup53-like蛋白的一级序列发生了广泛分化，但仍保留了保守的RNA识别基序（RNA recognition motif，RRM）样折叠；与此同时，该蛋白还呈现出谱系特异性特征，包括扩展的富含重复序列区域，以及通常与Nup155结合相关的C端区域发生截短。综上，这些发现扩展了目前已知的溶组织内阿米巴候选核孔蛋白，并揭示了其核孔相关网络：该网络既包含可识别的保守组分，也包含经过广泛重塑且尚未得到充分表征的蛋白。我们的研究突显了NPC在演化上的可塑性，并为理解核孔结构如何在高度分化的真核生物谱系间发生多样化提供了一个框架。

核孔复合体（NPC）是细胞核与细胞质之间进行大分子交换的门户。尽管在真核生物中，NPC的整体结构具有广泛的保守性，但其在不同谱系中已发生了显著的特异性分化，尤其是在进化上较为分化的原生生物中。本文研究了溶组织内阿米巴（*Entamoeba histolytica*）的NPC。溶组织内阿米巴是一种进化上高度分化的变形虫类生物，也是阿米巴病的病原体。我们以含FG重复序列的核孔蛋白EhNup98-like为诱饵，结合亲和纯化与质谱分析，鉴定出多种相关蛋白，其中包括一种此前未被表征的候选核孔蛋白，其与Nup53/Nup35具有相似性。对EhNup53-like开展的互惠蛋白质组学分析进一步鉴定出更为广泛的候选NPC组分，包括与保守核孔蛋白相对应的蛋白，以及若干未被表征的核孔相关蛋白。结构分析表明，尽管EhNup53-like蛋白的一级序列发生了广泛分化，但其仍保留了保守的RNA识别基序（RRM）样折叠；同时，该蛋白还呈现出谱系特异性特征，包括扩展的富含重复序列区域，以及通常与Nup155结合相关的C端区域发生截短。综上，这些发现扩展了目前已知的*E. histolytica*候选核孔蛋白，并揭示了其NPC相关网络：该网络既包含可辨识的保守组分，也包含经历了大幅重塑且尚未得到充分表征的蛋白质。我们的研究凸显了NPC的进化可塑性，并为理解核孔结构如何在高度分化的真核生物谱系中发生多样化提供了框架。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.13.750810v1?rss=1

🏷️ 核孔复合体 核孔蛋白 进化多样化 溶组织内阿米巴 蛋白质组学