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背景：Rvi6基因源自Malus floribunda 821，是应用最广泛的苹果黑星病抗性基因，但能够克服该基因抗性的Venturia inaequalis小种已广泛存在。同一寄主基因型中，Rvi6抗性互作与Rvi6抗性被突破互作之间的转录组差异尚未得到解析。目的：比较‘Ametyst’品种中的这两类互作，并筛选拟开展后续验证的候选基因。方法：对自根‘Ametyst’植株进行模拟接种，或分别接种Rvi6非致病菌株（Rin；不亲和互作）和Rvi6致病菌株（Rola；亲和互作），于接种后4天取样（共获得21个mRNA文库）。采用基于GDDH13参考基因组的分析策略和Trinity从头组装策略进行表达定量，随后开展DESeq2、WGCNA和GSEA分析。结果：在基于参考基因组的分析中，Rin与Rola比较获得了1,339个候选基因（表达变化超过2倍，FDR苹果品种 Ametyst 与 Rvi6 有效型和 Rvi6 突破型苹果黑星病菌互作的转录组鉴定出防御候选基因 | bioRxiv
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苹果品种 Ametyst 与 Rvi6 有效型和 Rvi6 突破型苹果黑星病菌互作的转录组鉴定出防御候选基因
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Sunee Kertbundit， Dimitrij Tyc， Radek Cerny， Helena Storchova， Miloslav Juricek
doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.15.751701
Sunee Kertbundit 捷克科学院实验植物学研究所
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Dimitrij Tyc 捷克科学院实验植物学研究所
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Radek Cerny 捷克科学院实验植物学研究所
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Helena Storchova 捷克科学院实验植物学研究所
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Miloslav Juricek 捷克科学院实验植物学研究所
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通讯作者： juricek{at}ueb.cas.cz
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摘要
背景：Rvi6 基因导入自 Malus floribunda 821，是目前应用最广泛的苹果黑星病抗性基因，但能够克服该基因的苹果黑星病菌（Venturia inaequalis）生理小种已广泛分布。在同一寄主基因型中，Rvi6 有效型互作与 Rvi6 突破型互作之间的转录组差异尚未得到解析。
目的：比较 Ametyst 品种中的这两类互作，并提名供后续验证的基因。
方法：将自根 Ametyst 植株进行模拟接种，或分别接种 Rvi6 非致病性菌株（Rin；不亲和互作）和 Rvi6 致病性菌株（Rola；亲和互作），并于接种后第 4 天采样（共获得 21 个 mRNA 文库）。采用基于 GDDH13 参考基因组的分析策略和从头 Trinity 组装策略对表达水平进行定量，随后使用 DESeq2、WGCNA 和 GSEA 进行分析。
结果：在基于参考基因组的分析中，Rin 与 Rola 的比较获得了 1,339 个候选基因（变化倍数超过 2 倍，FDR
结论：不亲和互作与一个协调一致的防御程序相关，而亲和互作则表现出不同的转录状态。由于每类互作仅使用了一个菌株，因此无法区分菌株本身的影响与 Rvi6 致病性之间的作用。
利益冲突声明
资助者信息声明
捷克共和国农业部通过国家农业研究局，以及农业部 2017—2025 年应用研究计划（ZEMĚ）提供资助，项目编号：QK21010390
版权
本预印本的。
该文根据 CC-BY 4.0 国际许可协议公开发布。
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发布于 2026 年 9 月 17 日。
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苹果品种 Ametyst 与 Rvi6 有效型和 Rvi6 突破型苹果黑星病菌互作的转录组鉴定出防御候选基因
Sunee Kertbundit， Dimitrij Tyc， Radek Cerny， Helena Storchova， Miloslav Juricek
bioRxiv 2026.09.15.751701； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.15.751701
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苹果品种 Ametyst 与 Rvi6 有效型和 Rvi6 突破型苹果黑星病菌互作的转录组鉴定出防御候选基因
Sunee Kertbundit， Dimitrij Tyc， Radek Cerny， Helena Storchova， Miloslav Juricek
bioRxiv 2026.09.15.751701； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.15.751701
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.15.751701v1?rss=1
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