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生物体必须适应发生于多个时间尺度上的环境变化,而内源性多尺度时钟则通过将生理活动和行为与周期性环境节律相协调来发挥作用,其中包括占主导地位的24小时周期以及更快的超昼夜节律。马德拉蜚蠊(*Rhyparobia maderae*)为研究这种多尺度时间组织提供了适宜的模型。在本研究中,研究者在持续黑暗条件下,通过跑轮实验记录其运动活动。尽管内源性昼夜节律时钟产生了清晰可见的24小时节律,但运动行为是否还表现出其他时间尺度上的时间模式,仍是未知的。经典频率分析无法发现这些时间模式,因为它们被昼夜节律的高次谐波所掩盖,而后者处于相同的频率范围内。研究采用无监督机器学习方法,包括K均值聚类、自组织映射和高斯混合模型,以探寻运动活动中可能与昼夜周期相关的快速超昼夜节律。在应用这些方法之前,研究首先定义了若干数据指标,用于刻画活动间歇(称为“活动脉冲”)以及活动减弱时段。研究在这些活动指标中发现了一种随机模式,用以表征活动脉冲之间的时间间隔。综合所有分析方法,在活动峰值出现的时间上均识别出一种一致的、周期约为1小时的超昼夜节律。该节律主要在主观夜间被检测到,提示其受到昼夜节律控制;同时,该节律似乎由两个组分构成,其周期分别约为40分钟和1.5小时。本文提出的方法应用于两个活动水平不同的蜚蠊群体,并且可推广至以时间序列形式呈现且具有主导节律的多种数据集。
使用机器学习表征蟑螂 Rhyparobia maderae 的节律性转轮行为模式 | bioRxiv
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使用机器学习表征蟑螂 Rhyparobia maderae 的节律性转轮行为模式
Johanna Olschewski , Angelika Brückner-Foit , 查看 ORCID 个人档案 Natalia Filimonova , 查看 ORCID 个人档案 Huleg Zolmon , 查看 ORCID 个人档案 Monika Stengl , 查看 ORCID 个人档案 Elfriede Friedmann
doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.11.747745
Johanna Olschewski 1 卡塞尔大学:Universitat Kassel;
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Angelika Brückner-Foit 1 卡塞尔大学:Universitat Kassel;
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Elfriede Friedmann 2 卡塞尔大学数学与自然科学系
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通讯作者:
friedmann{at}mathematik.uni-kassel.de
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生物体必须适应发生于多个时间尺度上的环境变化,而内源性多尺度生物钟则协调生理和行为,使其与反复出现的环境节律相匹配,其中包括占主导地位的 24 小时周期以及更快的超昼夜节律。马德拉蟑螂(Rhyparobia maderae)为研究这种多尺度时间组织提供了合适的模型。在本研究中,我们在持续黑暗条件下通过转轮实验记录了其运动活动。尽管内源性昼夜节律生物钟会产生清晰可见的 24 小时节律,但运动行为是否还表现出其他时间尺度上的时间模式,仍然未知。经典频率分析无法发现这些时间模式,因为它们被昼夜节律的高次谐波所掩盖,而这些高次谐波处于相同的频率范围内。研究采用无监督机器学习方法,包括 K-Means 聚类、自组织映射和高斯混合模型,以探寻运动活动中可能与昼夜节律周期相关的快速超昼夜节律。在应用这些方法之前,我们定义了用于刻画活动发作(称为活动脉冲)相对于低活动期的若干数据指标。在这些活动指标中发现了一种随机模式,该模式刻画了活动脉冲之间的时间间隔。在所有分析方法中,均一致识别出一种约为 1 小时的超昼夜节律,表现为活动峰值出现时间的节律性变化。这种节律主要在主观夜间检测到,提示其可能受到昼夜节律控制;同时,该节律似乎由两个周期成分构成,周期分别约为 40 分钟和 1.5 小时。本文提出的方法应用于两个活动水平不同的蟑螂群体,并且可推广至多种以时间序列形式出现、具有主导节律的数据集。
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脚注
https://zenodo.org/records/21755835
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发布于 2026 年 9 月 15 日。
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使用机器学习表征蟑螂 Rhyparobia maderae 的节律性转轮行为模式
Johanna Olschewski , Angelika Brückner-Foit , Natalia Filimonova , Huleg Zolmon , Monika Stengl , Elfriede Friedmann
bioRxiv 2026.09.11.747745; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.11.747745
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使用机器学习表征蟑螂 Rhyparobia maderae 的节律性转轮行为模式
Johanna Olschewski , Angelika Brückner-Foit , Natalia Filimonova , Huleg Zolmon , Monika Stengl , Elfriede Friedmann
bioRxiv 2026.09.11.747745; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.11.747745
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.11.747745v1?rss=1
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