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1. 监测自由生活动物的昼夜活动模式在方法学上颇具挑战性。部署于 Motus 野生动物追踪系统中的甚高频（VHF）无线电发射器所产生的信号强度波动，可作为活动水平的替代指标。然而，目前仍需要相应的分析工具，以从这些数据中提取能够量化活动模式的行为指标。 2. 我们开发了 roostR，这是一款开源 R 软件包，可将 Motus 检测数据转换为定量行为指标，包括开始栖息与离开栖息的时间、栖息持续时间、观测时间以及躁动程度。该软件包采用围绕信号波动性和滚动中位数构建的序贯分析流程，用于检测活动状态与非活动状态之间的转换。默认参数值基于 55 只在俄亥俄州东南部越冬的暗眼灯草鹀（*Junco hyemalis*）数据进行了调校。 3. 我们提供了一个暗眼灯草鹀在 58 天期间的数据示例。roostR 在 48 个夜晚估计出了开始栖息的时间，并在 56 个清晨估计出了离开栖息的时间；白天的滚动中位数信号差异高于夜间，这与该物种为昼行性动物的特征一致，同时每晚的躁动时段也存在差异。我们还利用该软件包估计了一只美洲树麻雀（*Spizelloides arborea*）连续 43 个夜晚的栖息行为。 4. roostR 使研究人员能够从 Motus 数据集中提取个体活动数据。由于所有阈值均可由用户调整，该分析流程能够适用于不同物种、标签规格和生态情境，从而使研究人员能够检验环境因素如何影响昼夜活动模式的相关假设。
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摘要
1. 监测野生动物的昼夜活动模式是一项方法学挑战。部署于 Motus 野生动物追踪系统中的甚高频（VHF）无线电发射器的信号强度波动，可作为活动水平的替代指标。然而，仍需要分析工具从这些数据中提取能够量化活动模式的行为指标。
2. 我们开发了 roostR，这是一个开源 R 软件包，可将 Motus 检测数据转换为定量行为指标，包括开始栖息和离开栖息的时间、栖息持续时间、观测时间以及躁动程度。该软件包采用基于信号波动性和滚动中位数的序贯分析流程，用于检测活动状态与非活动状态之间的转换。默认参数值基于美国俄亥俄州东南部越冬的 55 只暗眼灯草鹀（*Junco hyemalis*）的数据进行了调校。
3. 我们以一只暗眼灯草鹀在 58 天期间的数据为例。roostR 在 48 个夜晚估算出开始栖息时间，并在 56 个早晨估算出离开栖息地的时间；白天的滚动中位数信号差异高于夜间，这与昼行性动物的特征一致，同时每晚的躁动时段也各不相同。我们还使用该软件包估算了 1 只美洲树麻雀（*Spizelloides arborea*）连续 43 个夜晚的栖息行为。
4. roostR 使研究人员能够从 Motus 数据集中提取个体活动数据。由于所有阈值均可由用户调整，该分析流程能够适用于不同物种、标签规格和生态情境，从而帮助研究人员检验环境因素如何影响昼夜活动模式的相关假设。
利益冲突声明
脚注
https://github.com/ecologykelly/roostR
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本预印本的。
该内容依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。
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发布于 2026 年 9 月 15 日。
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roostR：一个用于利用 Motus 无线电遥测数据研究昼夜活动模式的 R 软件包
Kelly A Williams、Jacob E Morgan、Susan M Lyons
bioRxiv
2026.09.10.750597；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.09.10.750597
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roostR：一个用于利用 Motus 无线电遥测数据研究昼夜活动模式的 R 软件包
Kelly A Williams、Jacob E Morgan、Susan M Lyons
bioRxiv
2026.09.10.750597；
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https://doi.org/10.64898/2026.09.10.750597
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.10.750597v1?rss=1
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