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现有的谱系分析方法在识别新生突变（DNM）时，至少需要双亲和一个子代，因此其适用范围受到限制。在此，我们提出 OOPS（Only One Parent Sequencing，单亲测序）框架，仅利用一对单亲—子代样本检测新生突变。OOPS 利用亲本的短读长测序数据，以及子代的短读长和长读长测序数据，在子代中重建单倍型，随后可将其中一个单倍型归属于已测序的亲本。我们表明，可以从所归属的单倍型中鉴定候选新生突变，并据此估算突变率。为验证 OOPS 的准确性，我们将其应用于一个人类谱系；在该谱系中，研究人员还采用标准的三联体分析方法鉴定了突变。OOPS 达到了与基于三联体的分析流程相当的准确性，并获得了一致的突变率估计结果。通过消除对完整三联体测序的要求，OOPS 将突变率估算拓展至更广泛的应用场景。
现有用于鉴定新生突变（DNM）的家系分析方法至少需要双亲和一个子代，因此其适用范围受到限制。在此，我们提出 OOPS（Only One Parent Sequencing，仅测序一位亲本）框架，仅利用一对单亲—子代样本检测新生突变。OOPS 使用亲本的短读长测序数据以及子代的短读长和长读长测序数据，在子代中重构单倍型，随后可将其中一个单倍型归属于已测序的亲本。我们表明，可从所归属的单倍型中鉴定候选新生突变，进而估算突变率。为验证 OOPS 的准确性，我们将其应用于一个人类家系；在该家系中，研究人员还采用标准的三联体分析方法鉴定了突变。OOPS 的准确性与基于三联体的分析流程相当，并获得了一致的突变率估计结果。通过取消完整三联体测序的要求，OOPS 将突变率估算拓展至更广泛的应用场景。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.11.751022v1?rss=1
🏷️ 从头突变 突变率估计 单亲测序 单倍型重建 长短读长测序
来源出处