生殖细胞以高于体细胞的保真度维持其基因组，但在脊椎动物中，生殖系状态如何系统性地塑造体细胞基因组保护，仍知之甚少。通过将生殖系消融与斑马鱼（Danio rerio）多器官转录组学相结合，我们解析了生殖系对体细胞DNA修复及基因毒性应激反应的调控作用。利用CRISPR/Cas9介导的生殖系决定基因dnd-1敲除，我们比较了无生殖系（germline-free，GLF）雄鱼与携带生殖系（germline-carrying，GLC）同窝个体在基线状态以及亚致死剂量γ射线照射后的差异，并分别于照射后3小时和24小时进行取样。生殖系消融深刻重塑了体细胞的基线转录图谱，使其倾向于表达较短且外显子丰富的基因；这些基因参与染色质完整性维持、细胞周期调控及高保真DNA修复，同时减弱了DREAM复合体对经典修复靶基因的抑制作用。照射后，GLF鱼类表现出更快的应答，迅速启动同源重组、检查点调控和蛋白质稳态维持；相比之下，GLC鱼类则持续偏向于生物合成和翻译相关程序。刺猬（Hedgehog）信号通路充当了一个瞬时调控节点，协调不同品系特异性的DNA损伤应答；同时，4号染色体上的一个富含重复序列区域成为基因与转座元件（transposable element，TE）协同活动的热点。照射后，GLF体细胞表现出较低的早期TE表达，其中LTR逆转座子与邻近差异表达基因显示出最强的一致性。我们的研究表明，生殖系状态是调节多器官体细胞基因组维护和TE动态的系统层面开关，并为理解生殖系如何调控脊椎动物体细胞衰老提供了分子框架。
生殖细胞以高于体细胞的保真度维持其基因组，但在脊椎动物中，生殖系状态如何系统性地塑造体细胞基因组保护机制，仍缺乏深入认识。我们将生殖系消融与斑马鱼（Danio rerio）多器官转录组学相结合，解析了生殖系对体细胞DNA修复和基因毒性应激反应的调控作用。通过采用CRISPR/Cas9介导的生殖系决定基因 dnd-1 敲除，我们比较了无生殖系（GLF）雄鱼与具有生殖系（GLC）的同胞鱼在基线状态以及亚致死剂量γ射线照射后的差异，并分别于照射后3小时和24小时取样。生殖系消融显著重组了体细胞的基线转录状态，倾向于表达长度更短、外显子更丰富且参与染色质完整性、细胞周期调控和高保真DNA修复的基因，同时减弱了DREAM复合体对经典修复靶基因的抑制作用。照射后，GLF鱼表现出更为迅速的应答，快速启动同源重组、检查点调控和蛋白质稳态维持；相比之下，GLC鱼仍偏向于生物合成和翻译相关程序。Hedgehog信号通路作为一个瞬时调控节点，协调了不同品系特异性的DNA损伤应答；此外，4号染色体上的一个富含重复序列区域成为基因与转座元件（TE）协同活动的热点。照射后，GLF鱼体细胞中早期TE表达降低，其中LTR逆转座子与邻近差异表达基因表现出最强的一致性。我们的研究表明，生殖系状态是调节多器官体细胞基因组维护和TE动态的系统性开关，并为理解生殖系如何调控脊椎动物体细胞衰老提供了分子框架。
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