C9orf72六核苷酸重复序列的代际不稳定性

root 提交于 周三, 09/16/2026 - 18:47
C9orf72六核苷酸重复扩增(hexanucleotide repeat expansion,HRE)是肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)最常见的病因。在家系中,该扩增呈常染色体显性遗传;然而,相当高比例的病例为散发性病例,这提示其父母可能携带前突变。我们已证实,含有>18次重复的中等长度等位基因(intermediate-length alleles,IAs;等位基因频率约为1%)与HRE属于同一单倍型群,提示二者具有共同的祖先来源。在本研究中,我们检验了含有>18次重复的等位基因是否会在亲代传递过程中发生扩增。我们采用两种重复引物PCR方法,分析了539对未经遗传学筛选的亲代-子代样本,以及芬兰境内152对已知携带SNP(rs139185008*C)的亲代-子代样本;该SNP可标记含有>18次重复的IAs及HRE。我们仅在含有>20次重复的等位基因中发现了代际重复长度变化。采用逻辑回归模型分析6~40次重复等位基因时,观察到显著的性别偏倚(P = 0.0059)。在这一等位基因范围内,16例扩增中有12例为父系遗传,而7例收缩中有6例为母系遗传。含有20~40次重复的等位基因,其扩增率在父系传递中为34%,在母系传递中为11%。在20~40次重复范围内,大多数代际扩增的幅度为1~4次重复(15/16);但我们观察到一次幅度较大的跳跃,即某一等位基因由父系传递时从27次扩增至73次重复。这些结果表明,含有>20次重复的等位基因发生不稳定的可能性增加;在含有20~40次重复的等位基因中可观察到父系扩增偏倚;并且扩增事件的幅度主要为1~4次重复。

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C9orf72 六核苷酸重复扩增(hexanucleotide repeat expansion,HRE)是肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)最常见的病因。该扩增在家族中遵循常染色体显性遗传模式;然而,较高比例的病例为散发性病例,这提示其亲本可能携带前突变。我们已证实,具有超过 18 次重复的中等长度等位基因(intermediate-length alleles,IAs;等位基因频率约为 1%)与 HRE 属于同一单倍型库,提示二者具有共同祖源。在本研究中,我们检测了具有超过 18 次重复的等位基因是否会在亲本传递过程中发生扩增。我们采用两种重复引物 PCR 方法,分析了 539 对未经遗传学筛选的亲代–子代样本,以及芬兰境内 152 对已知携带标记超过 18 次重复的 IA 和 HRE 的 SNP(rs139185008*C)的样本。我们仅在重复次数超过 20 次的等位基因中发现了代际重复长度变化。采用逻辑回归模型分析 6–40 次重复的等位基因时,发现了显著的(P = 0.0059)性别偏倚。在这一等位基因范围内,16 例扩增中有 12 例为父系遗传,而 7 例收缩中有 6 例为母系遗传。20–40 次重复等位基因在父系传递中的扩增率为 34%,在母系传递中的扩增率为 11%。在 20–40 次重复范围内,大多数代际扩增的幅度为 1–4 次重复(15/16);但观察到一次较大幅度的跳跃,即一例父系传递中重复次数由 27 次扩增至 73 次。这些结果表明,重复次数超过 20 次的等位基因发生不稳定的可能性增加;在重复次数为 20–40 次的等位基因中可观察到父系扩增偏倚;且扩增事件的幅度主要为 1–4 次重复。

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发布于 2026 年 9 月 15 日。

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C9orf72 六核苷酸重复的代际不稳定性

Osma S. Rautila

Anna Kiviharju

Lilja Jansson

FinnGen

Karri Kaivola

Pentti J. Tienari

bioRxiv

2026.09.10.750611;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.09.10.750611

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C9orf72 六核苷酸重复的代际不稳定性

Osma S. Rautila

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2026.09.10.750611;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.09.10.750611


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.10.750611v1?rss=1

🏷️ C9orf72六核苷酸重复扩增 代际不稳定性 重复序列扩增 父系遗传偏倚 肌萎缩侧索硬化症 额颞叶痴呆