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在同一组织切片上整合空间代谢组学与空间蛋白质组学仍面临挑战，这是因为基质辅助激光解吸/电离质谱成像（MALDI-MSI）和基于激光捕获显微切割（LCM）的蛋白质组学对样品载玻片提出了不同要求。在本研究中，我们开发并系统评价了一种导电的氧化铟锡涂层聚对苯二甲酸乙二醇酯（ITO-PET）载玻片，可实现对同一组织切片依次进行MALDI-MSI和LCM-液相色谱-质谱（LCM-LC-MS）分析。以小鼠脑组织为模型，ITO-PET表现出与传统ITO玻璃高度接近的MALDI-MSI性能，包括光谱一致性（Pearson相关系数，R = 0.90）、离子检测覆盖度、代谢物注释、信号强度分布以及空间分子模式的保留。完成MALDI-MSI后，ITO-PET载玻片仍支持切割模式的LCM，并获得了与传统聚萘二甲酸乙二醇酯（PEN）玻璃载玻片相当的蛋白质组信号强度和鉴定蛋白质组群数量。在不同组织取样区域中，MALDI-MSI前后的蛋白质组信号强度分布、前体离子数量和蛋白质组群鉴定结果总体保持可比，且所鉴定蛋白质组群之间存在较大重叠。在小鼠肾脏、肺、脾脏和肝脏组织中也观察到类似结果，进一步支持了该工作流程在不同组织类型中的适用性。ITO-PET载玻片兼具MALDI-MSI所需的导电性和LCM切割所需的机械性能，解决了两种分析技术之间一个主要的材料兼容性问题，从而能够对同一组织切片依次开展空间代谢组学和蛋白质组学分析。该工作流程为从空间受限的生物样本中获取互补性分子信息提供了一个实用的分析平台。
在同一组织切片上整合空间代谢组学与空间蛋白质组学仍面临挑战，这是因为基质辅助激光解吸/电离质谱成像（MALDI-MSI）与基于激光捕获显微切割（LCM）的蛋白质组学对样品载玻片提出了不同要求。在本研究中，我们开发并系统评估了一种导电的氧化铟锡涂层聚对苯二甲酸乙二醇酯（ITO-PET）载玻片，可对同一组织切片依次进行MALDI-MSI和LCM-液相色谱-质谱（LCM-LC-MS）分析。以小鼠脑组织为模型，ITO-PET在MALDI-MSI中的性能与传统ITO玻璃高度相近，包括光谱一致性（Pearson相关系数，R = 0.90）、离子检测覆盖范围、代谢物注释、信号强度分布以及空间分子模式的保留情况。完成MALDI-MSI后，ITO-PET载玻片支持切割模式的LCM，并获得了与传统PEN玻璃载玻片相当的蛋白质组学信号强度和蛋白质组鉴定数量。在不同组织取样区域中，MALDI-MSI前后的蛋白质组学信号强度分布、前体离子数量及蛋白质组鉴定结果总体保持可比，并且鉴定出的蛋白质组之间存在较大程度的重叠。在小鼠肾脏、肺、脾脏和肝脏组织中也观察到类似结果，进一步支持了该流程在不同组织类型中的适用性。通过将MALDI-MSI所需的导电性与LCM切割所需的机械性能相结合，ITO-PET载玻片解决了这两种分析模式之间的主要材料不兼容问题，从而能够在同一组织切片上依次开展空间代谢组学和蛋白质组学分析。该流程为从空间受限的生物样本中获取互补性分子信息提供了一个实用的分析平台。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.07.749981v1?rss=1
🏷️ 空间代谢组学 空间蛋白质组学 MALDI质谱成像 激光捕获显微切割 ITO-PET载玻片 多组学整合