一种利用 RNA 片段末端连接(REJ)进行基因互补的交叉表达平台

root 提交于 周二, 09/15/2026 - 22:47
基因互补是遗传筛选和蛋白质功能研究中的有力工具,但通常需要对互补组分进行大规模筛选。在此,我们构建了一个基于RNA末端连接(RNA end-joining,REJ)的基因互补平台,能够将彼此分离的RNA单元精准且高效地剪接为具有功能的编码mRNA。REJ由长度约为250 bp的短结构化模块RNA片段介导,这些片段能够:(a)促进RNA::RNA相互作用;(b)劫持细胞内在的剪接机制,以促进RNA反式剪接;(c)减少未剪接RNA片段产生蛋白质片段的翻译;以及(d)编码无痕蛋白。我们证明,REJ是一种具有广泛适用性的系统,能够可靠地将几乎任何基因拆分为互补片段,而不受蛋白质结构的限制。为推动该系统的应用,我们提供了一套报告系统工具箱以及一个基于网络的设计工具,以便于载体设计。已展示的REJ应用包括遗传互补、细胞类型的交集式标记,以及大蛋白质的高效表达。

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Lukas C. Bachmann

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Ryan H. Hsu

Kip J. Hermann

Claire E. Williams

Richard L. Farman

Nicolas Criales

Craig Clark

Stella Kramer

Carolina Thorn Perez

Sawyer Randles

Karen Lettieri

Samuel L. Pfaff

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.09.13.751279

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基因互补是遗传筛选和蛋白质功能研究的有力工具,但通常需要对互补组分进行大规模筛选。在本研究中,我们构建了一种基于 RNA 末端连接(REJ)的基因互补平台,能够将彼此分离的 RNA 单元精准且高效地剪接为具有功能的编码 mRNA。REJ 由长度约为 250 bp 的短结构化模块 RNA 片段介导,这些片段能够:(a)促进 RNA::RNA 相互作用;(b)借用细胞内源性剪接机制,以促进 RNA 反式剪接;(c)减少未剪接 RNA 片段翻译产生蛋白质片段;以及(d)编码无残留序列的蛋白质。我们证明,REJ 是一种具有广泛适用性的系统,几乎能够将任何基因可靠地拆分为互补片段,而不受蛋白质结构的限制。为促进该系统的应用,我们提供了一套报告系统工具箱以及一个基于网络的设计工具,以便于载体设计。已展示的 REJ 应用包括遗传互补、细胞类型的交叉标记以及大蛋白质的高效表达。

利益冲突声明

萨尔克生物学研究所持有两项关于本研究所述 RNA 末端连接(REJ)技术的专利,这两项专利均已授权给 Insmed。S.L.P. 和 L.C.B. 是涵盖 REJ 核心技术专利的发明人;R.H.H.、C.E.W.、K.J.H.、L.C.B. 和 S.L.P. 是涵盖其他 REJ 技术的第二项专利的发明人。L.C.B. 是 Insmed 的员工,R.H.H. 是 Insmed 的顾问。其余已声明的资助信息

霍华德·休斯医学研究所

美国国防部(DoD)

,MD190071

美国国立卫生研究院 / 国家神经疾病与卒中研究所(NIH / NINDS)

,1R01 NS123160-01

Usher 1F 基金会

萨尔克研究所基因治疗基金

W. M. Keck 基金会

Mathers 基金会

Sol Goldman 慈善信托

美国国立卫生研究院 / 国家儿童健康与人类发育研究所(NIH / NICHD)

,F30 HD106732

美国国立卫生研究院 / 国家癌症研究所(NIH / NCI)(癌症中心支持基金)

版权

本预印本的。

本内容依据以下许可提供:

CC-BY 4.0 国际许可

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2026.09.13.751279;

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https://doi.org/10.64898/2026.09.13.751279

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2026.09.13.751279;

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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.13.751279v1?rss=1

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