循环小型细胞外囊泡的配对RNA谱分析揭示ALS患者生存与反应性胶质细胞-血管程序的关联

循环RNA能够捕捉与肌萎缩侧索硬化症（amyotrophic lateral sclerosis，ALS）进展相关的分子变异，但生物流体的异质性使得难以提取具有生物学组织性的信号。在本研究中，我们将来自谷氨酸-天冬氨酸转运体（glutamate-aspartate transporter，GLAST）阳性小型细胞外囊泡（small extracellular vesicles，sEVs）的微小RNA（microRNA，miRNA）和信使RNA（messenger RNA，mRNA）谱相结合，以估计生存时间并识别与生存相关的生物学程序。在45名ALS患者和15名对照者中，生物学约束的多组学因子分析识别出一个程序：其中，靶标支持的miRNA–mRNA配对之间相互对应的状态与生存时间相关。随后，我们在一个由248名ALS患者组成的独立全血浆队列中对miRNA分支进行了评估，进一步优化出一个包含5种miRNA的组合；除功能衰退和神经丝轻链之外，该组合还可提供额外的预后信息，尤其是在较长生存期范围内。我们还利用来自308名供者的586份皮质组织表达谱和来自69名供者的527,261个细胞核，对mRNA分支进行了评估，识别出一个与胶质细胞反应性、血管相关程序以及髓鞘形成细胞身份减弱相关的5基因核心。综上，这些发现建立了一个整合循环中调控性RNA层的框架，可用于识别具有临床意义的生物学程序，并将其与疾病相关的细胞状态联系起来。

循环RNA能够捕捉与肌萎缩侧索硬化症（ALS）进展相关的分子变异，但生物流体的异质性使得具有生物学组织性的信号难以被提取。在本研究中，我们结合了谷氨酸-天冬氨酸转运体（GLAST）阳性小型细胞外囊泡（sEVs）中的微小RNA（miRNA）和信使RNA（mRNA）谱，以估计生存时间并识别与生存相关的程序。在45名ALS参与者和15名对照者中，生物学约束的多组学因子分析鉴定出一个程序，其中靶标支持的miRNA-mRNA配对之间的互逆状态能够反映生存情况。随后，我们在一个独立的ALS全血浆队列中对该miRNA分支进行了评估，该队列包括248名参与者，并进一步优化出一个包含5种miRNA的组合；除功能衰退和神经丝轻链之外，该组合还提供了额外的预后信息，尤其是在较长生存期范围内。我们在来自308名供者的586份皮质样本和来自69名供者的527,261个细胞核中评估了mRNA分支，鉴定出一个与胶质细胞反应性、血管相关程序以及髓鞘形成特征降低相关的5基因核心。综上，这些研究结果建立了一个整合循环系统中不同调控RNA层级的框架，用于识别具有临床意义的程序，并将其与疾病相关的细胞状态联系起来。

J.S.W.和D.P.是Eatsrock Dx Inc.公司的共同创始人，并持有该公司的股权。F.B.和U.S.声明不存在利益冲突。

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🏷️ 肌萎缩侧索硬化症 细胞外囊泡 miRNA-mRNA配对 多组学分析 生存预后 反应性胶质细胞