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单细胞RNA测序(scRNA-seq)已成为研究损伤与修复过程中复杂组织内单个细胞群体的有力工具。然而,该技术涉及广泛的样本处理,从而限制了其在稀有且难以解离的细胞群体中的应用。单核RNA测序(snRNA-seq)规避了其中若干挑战,但其在肺部疾病模型中的表现尚未得到充分表征。在博来霉素诱导的肺损伤纵向小鼠模型中,我们对全肺进行了snRNA-seq,在仅进行最少组织处理的条件下,系统绘制了46种细胞群体及细胞状态的图谱。我们的方法捕捉到了损伤过程中Krt8^+/Cdkn1a^+过渡性肺泡细胞的出现以及巨噬细胞群体的扩增。此外,我们还鉴定出数量可观的稀有细胞类型群体,如周细胞,以及对消化方案敏感的细胞群体,包括一类活化成纤维细胞。这些结果表明,snRNA-seq能够重现此前利用单细胞方法报道的与损伤相关的动态变化,并且在表征对处理过程敏感的细胞类型方面优于这些方法,从而凸显了其在肺等异质性组织的高分辨率分析中的实用价值。
cfhung{at}uw.edu
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单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)已成为研究损伤与修复过程中复杂组织内单个细胞群体的有力工具。然而,该技术涉及大量样持有人为作者/资助方,其已授予bioRxiv许可,使其得以永久展示该预印本。
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发布于2026年9月14日。
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博来霉素诱导的肺损伤动态:单核分辨率分析
Cecilia Lopez-Martinez
Yu-Hua Chow
William A Altemeier
Sina A A Gharib
Chi F Hung
bioRxiv 2026.09.08.750170; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.08.750170
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博来霉素诱导的肺损伤动态:单核分辨率分析
Cecilia Lopez-Martinez
Yu-Hua Chow
William A Altemeier
Sina A A Gharib
Chi F Hung
bioRxiv 2026.09.08.750170; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.08.750170
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.08.750170v1?rss=1
🏷️ 单核RNA测序 肺损伤 细胞异质性 肺泡细胞 巨噬细胞 组织修复
来源出处
博来霉素诱导的肺损伤的单核分辨率动态变化
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.08.750170v1?rss=1