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肿瘤中包含多种T细胞，其中一些具有旁观者反应性，另一些则对不同的、且通常具有患者特异性的癌症（新）抗原具有反应性。对人类肿瘤中具有高度活性的TCR–抗原配对进行一步式鉴定，无论是作为监测工具，还是用于增强目标T细胞反应性，都具有重要价值。在此，我们开发了PAIR-Scan，这是一种不受HLA限制的文库对文库筛选技术，能够在单一步骤中，从数以万计的候选配对中鉴定出具有功能活性的TCR–新抗原配对。我们在多种肿瘤样本中验证了PAIR-Scan的应用价值，并利用该技术直接鉴定出可被TCR识别的最小肽。此外，我们还证明，对于识别同一抗原的TCR，PAIR-Scan能够按照其相对肿瘤杀伤效率进行正确排序。综上，这些数据表明，PAIR-Scan既适用于解析临床样本中的T细胞反应，也可用于生成大规模数据集，以开发TCR反应性的预测模型。
肿瘤中包含多种T细胞，其中既有具有旁观者反应性的T细胞，也有针对不同癌症（新）抗原的T细胞，而后者的靶抗原通常具有患者特异性。在人类肿瘤中一步鉴定具有高活性的TCR–抗原配对，不仅可作为监测工具，还有助于增强人们关注的T细胞反应。本文开发了PAIR-Scan，这是一种不依赖HLA的文库对文库筛选技术，能够在单一步骤中从数万个候选配对中鉴定具有功能活性的TCR–新抗原配对。我们在一系列肿瘤样本中验证了PAIR-Scan的应用价值，并利用该技术直接鉴定TCR所识别的最小肽。此外，我们还证明，PAIR-Scan能够根据针对同一抗原的TCR相对肿瘤杀伤效率，对其进行正确排序。综上，这些数据表明，PAIR-Scan既可用于解析临床样本中的T细胞反应，也可用于生成大规模数据集，以开发TCR反应性的预测模型。
T.N.S.担任Allogene Therapeutics、Merus、Neogene Therapeutics、JNJ和Scenic Biotech的顾问，并持有Allogene Therapeutics、Cell Control、Celsius、Merus、Polar Therapeutics和Scenic Biotech的股份。T.N.S.同时担任Third Rock Ventures的风险合伙人；上述任职和持股均与本投稿工作无关。J.B.A.G.H.担任AstraZeneca、BioNTech、BMS、Immatics、Iovance、Ipsen、Molecular Partners、Neogene Therapeutics、Novartis、Sastrā、T-Knife、Third Rock Ventures和Tzu的顾问；曾获得Asher Bio、BioNTech、BMS和Sastrā的研究资助；并持有Sastrā的股票期权。C.J.W.持有BioNTech的股权；并担任Repertoire、Aethon Therapeutics、Nature's Toolbox和Adventris的科学顾问委员会成员。
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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.07.749948v1?rss=1
🏷️ TCR-新抗原配对 文库对文库筛选 肿瘤免疫学 T细胞受体反应性 抗原识别 免疫监测