HARIBOSS++：一个用于 RNA 靶向药物设计的集成平台

利用小分子靶向RNA正日益被视为未来治疗策略的关键方向。研究RNA-小分子（RNA-SM）相互作用的一项主要限制在于可获得的实验结构数量不足。HARIBOSS作为一个来源于蛋白质数据库（Protein Data Bank）的RNA-SM复合物整理数据库，树立了里程碑式的成果。在其社区参与基础上，我们推出了HARIBOSS++这一更新的新一代平台，旨在推动未来RNA靶向药物的研究。主要更新包括扩展结合口袋组（pocketome），涵盖小分子不仅与RNA相互作用、还与其他生物分子相互作用的结合位点；增强按RNA家族对RNA分子的分析；开展详细的三维结构表征；改进对配体化学空间的分析；并在可获得的情况下，增加实验测定的结合亲和力数据以及分子动力学数据。HARIBOSS++为生物学家、生物信息学家和机器学习研究人员在更大尺度上探索RNA-SM相互作用开辟了新的途径。HARIBOSS++可通过https://hariboss.pasteur.cloud提供的免费网页界面进行访问。

利用小分子靶向RNA正日益被视为未来治疗策略的关键方向。研究RNA-小分子（RNA-SM）相互作用的一项主要局限，在于可获得的实验结构数量不足。HARIBOSS作为一个基于蛋白质数据库（Protein Data Bank）构建的RNA-SM复合物整理数据库，确立了该领域的重要里程碑。在其社区参与基础上，我们推出了HARIBOSS++，这是一个面向未来RNA靶向药物研究、经过更新并实现新一代升级的平台。主要更新包括扩展口袋组（pocketome），纳入小分子不仅与RNA相互作用、还与其他生物分子发生相互作用的结合位点；增强按家族对RNA分子进行分析的能力；对三维结构进行详细表征；改进对配体化学空间的分析；以及在可获得的情况下，加入实验测定的结合亲和力和分子动力学数据。HARIBOSS++为生物学家、生物信息学家和机器学习研究人员提供了新的途径，使其能够在全新尺度上研究RNA-SM相互作用。HARIBOSS++可通过https://hariboss.pasteur.cloud上的网页界面免费访问。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.07.749797v1?rss=1

🏷️ RNA-小分子相互作用 RNA靶向药物设计 结构生物信息学 结合口袋分析 分子动力学 配体化学空间