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背景：精英控制者（elite controllers，ECs）是指无需接受抗逆转录病毒治疗（antiretroviral therapy，ART）即可抑制病毒复制的HIV感染者（people with HIV，PWH）。其中一部分通常被称为特殊精英控制者（exceptional elite controllers，EECs），其体内病毒储存库极小，仅有少量完整前病毒整合于染色体非活跃区域。在ECs中界定炎症特征，有助于明确其中部分个体是否接近功能性治愈状态。 方法：我们采用Olink蛋白质组学技术，检测了未经ART治疗的ECs（n=62）、经ART抑制的非控制者（n=37）以及无HIV感染者（people without HIV，PwoH）（n=50）血浆中的384种蛋白，并利用FLIP-Seq比较其蛋白质组学特征、临床参数和完整病毒储存库数据。通过层次聚类识别出蛋白质组学特征最接近PwoH的ECs，并进一步采用机器学习方法对该亚组进行分析。 结果：与未经ART治疗的ECs相比，经ART抑制的非控制者具有更高水平的炎症相关蛋白；然而，与PwoH相比，ECs仍表现出炎症水平升高以及CD4/CD8比值降低。聚类分析发现，ECs中存在一个独特亚组（n=9），其蛋白质组学特征与无HIV感染者高度相似（具有PwoH样蛋白质组学特征的ECs）；在经ART抑制的非控制者中未观察到这一模式。与典型ECs相比，具有PwoH样蛋白质组学特征的ECs始终表现出较低水平的IL-1β、SCRN1和BID，完整前病毒频率在数值上更低，并且保护性HLA等位基因的携带频率较高。机器学习分析进一步突出显示了区分具有PwoH样蛋白质组学特征的ECs与典型ECs的主要特征，包括肠道黏膜/肠上皮相关蛋白减少、绝对CD4细胞计数较高，以及促炎性细胞因子和细胞免疫活化水平较低。 结论：本研究发现了一个具有PwoH样炎症蛋白质组学特征的ECs亚组，该亚组同时伴有数值上更低的完整HIV储存库和较高频率的保护性HLA等位基因。明确与这种低炎症状态相关的机制，可能有助于深入理解特殊的HIV控制现象，并为实现持久性HIV缓解的策略提供依据。
血浆蛋白质组学分析鉴定出一组具有类似无 HIV 感染者炎症特征的 HIV 精英控制者 | bioRxiv
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血浆蛋白质组学分析鉴定出一组具有类似无 HIV 感染者炎症特征的 HIV 精英控制者
Shane D Falcinelli，David P Maison，Isaac Avila-Vargas，Thomas Dalhuisen，Chenyang Jiang，Xiaodong Lian，Ce Gao，Min-Gyoung Shin，Reuben Thomas，Jean Feng，James Salazar，Rebecca Hoh，Jeffrey N Martin，Steven P Deeks，Peter W Hunt，Mathias Lichterfeld，Xu Yu，Timothy J Henrich，Michael J Peluso
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.09.06.749753
Shane D Falcinelli 1 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校实验室医学系； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
David P Maison 2 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校医学院实验医学部； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Isaac Avila-Vargas 3 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校 HIV、传染病与全球医学部； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Thomas Dalhuisen 3 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校 HIV、传染病与全球医学部； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Chenyang Jiang 4 美国马萨诸塞州剑桥，MGH、麻省理工学院与哈佛大学拉贡研究所； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Xiaodong Lian 4 美国马萨诸塞州剑桥，MGH、麻省理工学院与哈佛大学拉贡研究所； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Ce Gao 4 美国马萨诸塞州剑桥，MGH、麻省理工学院与哈佛大学拉贡研究所； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Min-Gyoung Shin 5 美国加利福尼亚州旧金山，格莱斯顿研究所，格莱斯顿数据科学与生物技术研究所； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Reuben Thomas 6 美国加利福尼亚州旧金山，格莱斯顿研究所，格莱斯顿数据科学与生物技术研究所； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Jean Feng 7 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校流行病学与生物统计学系； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
James Salazar 8 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校心脏病学部 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Rebecca Hoh 3 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校 HIV、传染病与全球医学部； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Jeffrey N Martin 7 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校流行病学与生物统计学系； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Steven P Deeks 3 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校 HIV、传染病与全球医学部； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Steven P Deeks 的 ORCID 记录
Peter W Hunt 2 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校医学院实验医学部； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Mathias Lichterfeld 4 美国马萨诸塞州剑桥，MGH、麻省理工学院与哈佛大学拉贡研究所； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Xu Yu 4 美国马萨诸塞州剑桥，MGH、麻省理工学院与哈佛大学拉贡研究所； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Timothy J Henrich 2 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校医学院实验医学部； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Michael J Peluso 3 美国加利福尼亚州旧金山，加州大学旧金山分校 HIV、传染病与全球医学部； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
通讯作者：
michael.peluso{at}ucsf.edu
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背景：精英控制者（elite controllers，ECs）是指无需接受抗逆转录病毒治疗（antiretroviral therapy，ART）即可抑制病毒复制的 HIV 感染者（people with HIV，PWH）。其中一部分人通常被称为特殊精英控制者（exceptional elite controllers，EECs），其体内病毒储存库极小，只有少数完整前病毒整合于处于失活状态的染色体区域中。明确 ECs 的炎症特征，有助于阐明其中部分人是否接近功能性治愈状态。
方法：采用 Olink 蛋白质组学技术检测未经抗逆转录病毒治疗（ART）的精英控制者（ECs，n=62）、经ART抑制的非控制者（n=37）和无HIV感染者（PwoH，n=50）的384种血浆蛋白，并结合 FLIP-Seq 比较其蛋白质组学特征、临床参数及完整病毒储存库数据。通过层次聚类识别蛋白质组学特征最接近 PwoH 的 ECs，并进一步采用机器学习方法对该亚组进行分析。
结果：与未经ART治疗的 ECs 相比，经ART抑制的非控制者具有更高水平的炎症相关蛋白；然而，与 PwoH 相比，ECs 仍表现出更高的炎症水平和更低的 CD4:CD8 比值。聚类分析发现，一个独特的 ECs 亚组（n=9）的蛋白质组学特征与无HIV感染者高度相似（即具有 PwoH 样蛋白质组学特征的 ECs），而在经ART抑制的非控制者中未观察到这一模式。与典型 ECs 相比，具有 PwoH 样蛋白质组学特征的 ECs 的 IL-1β、SCRN1 和 BID 水平始终较低，完整前病毒频率在数值上更低，且保护性 HLA 等位基因的携带频率较高。机器学习分析进一步揭示了最能区分具有 PwoH 样蛋白质组学特征的 ECs 与典型 ECs 的特征，包括肠道黏膜/肠上皮相关蛋白水平降低、绝对 CD4 计数较高，以及促炎性细胞因子和细胞免疫活化水平较低。
结论：这些研究结果确定了一组具有类似无HIV人群（PWoH）炎症性蛋白质组特征的精英控制者（EC），其完整HIV储存库在数值上较低，且保护性HLA等位基因的频率较高。阐明与这种低炎症状态相关的机制，可能有助于深入理解HIV的极佳控制，并为实现持久性HIV缓解的策略提供依据。
利益冲突声明
已声明的资助者信息
NIH ，K23AI157875（MJP） ，5UM1AI164560-04（SGD）
版权
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本内容依据 CC-BY-NC-ND 4.0国际许可协议 提供。
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发布于2026年9月13日。
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Peter W Hunt
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Mathias Lichterfeld
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Xu Yu
，
Timothy J Henrich
，
Michael J Peluso
bioRxiv
2026.09.06.749753；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.09.06.749753
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James Salazar
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Rebecca Hoh
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Jeffrey N Martin
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Steven P Deeks
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Peter W Hunt
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Mathias Lichterfeld
，
Xu Yu
，
Timothy J Henrich
，
Michael J Peluso
bioRxiv
2026.09.06.749753；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.09.06.749753
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.06.749753v1?rss=1
🏷️ HIV精英控制者 血浆蛋白质组学 炎症特征 病毒储存库 保护性HLA等位基因 机器学习