一组多样性杂交小鼠胚胎干细胞:助力体外表征天然遗传变异的功能

由 root 提交于 周一, 09/14/2026 - 18:49
多能干细胞中的表型变异主要源于遗传变异,这些变异会影响多能状态的稳定性、对分化信号的响应以及细胞命运的多样化。源自遗传参考群体的细胞面板利用遗传多样性,绘制影响这些分子和细胞性状的基因座图谱。在此,我们介绍了针对小鼠(Mus musculus)体外系统遗传学的首个公开可用资源:从多样性远交(Diversity Outbred)小鼠中建立的299个遗传多样且高度杂合的胚胎干细胞系,这些细胞系在整个面板中具有极低的亲缘关系。我们对该面板的基因组完整性和等位基因变异进行了表征,并描述了胚样体中多能性网络和分化网络的差异。在胚样体中绘制镉暴露响应下基因表达差异的遗传决定因素时,我们鉴定出13个调控热点,其中效应最大的热点作用于核糖体生物发生相关基因。该面板能够绘制影响多能细胞及其衍生细胞类型分子身份的基因座和基因—环境互作图谱。

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Christopher L Baker

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https://doi.org/10.64898/2026.09.11.747888

Morgan M Brady 1 哺乳动物遗传学,杰克逊实验室,美国缅因州巴港;

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通讯作者:

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多能干细胞中的表型变异主要源于影响多能状态稳定性、对分化信号的响应以及细胞命运多样化的遗传变异。源自遗传参考群体的细胞系面板利用遗传多样性,能够定位影响这些分子和细胞性状的基因座。在此,我们介绍首个面向体外Mus musculus系统遗传学研究的公开资源:299个遗传多样性丰富、高度杂合的胚胎干细胞系,这些细胞系来源于Diversity Outbred小鼠,且面板内各细胞系之间的亲缘关系极低。我们表征了整个面板的基因组完整性和等位基因变异,并描述了胚样体中多能性网络和分化网络的差异。在胚样体中绘制镉暴露响应性基因表达差异的遗传决定因素时,我们鉴定出13个调控热点,其中影响核糖体生物发生基因的热点效应最大。该细胞系面板能够定位影响多能细胞及其衍生细胞类型分子身份的基因座和基因—环境互作。

利益冲突声明

资助者信息声明

美国国立卫生研究院研究基础设施项目办公室 ,R24OD030037

美国国立普通医学科学研究所 ,R35GM133724

版权

本预印本的。

该预印本依据CC-BY-NC-ND 4.0国际许可协议提供。

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发布于2026年9月13日。

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2026.09.11.747888;

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https://doi.org/10.64898/2026.09.11.747888

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https://doi.org/10.64898/2026.09.11.747888


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.11.747888v1?rss=1

🏷️ 多样性远交小鼠 胚胎干细胞 遗传变异 体外系统遗传学 基因表达调控 基因—环境互作