scOLAR：本体锚定的单细胞RNA测序数据开放集注释

单细胞RNA测序能够在图谱尺度上刻画细胞异质性，因此自动化注释至关重要。然而，目标数据集通常包含不完整参考数据集中所缺失的新型细胞类型。我们提出了scOLAR，一种本体指导的开放集框架，在细胞本体（Cell Ontology）上学习原型，并结合参考数据与目标数据的表达信息，在注释已知类别的同时检测未知细胞群体。在本体层级结构和决策边界正则化的引导下，scOLAR能够惩罚粗粒度谱系误分类，并在无需预先设定聚类数量的情况下对新型细胞进行分组。在多项基准测试中，scOLAR在新颖性检测任务上取得了0.9726的AUROC和0.9871的平均精确率，从而能够对参考数据集中缺失的细胞群体开展结构化的事后谱系层面解释。

juwei{at}scu.edu.cn

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单细胞 RNA 测序能够以图谱规模刻画细胞异质性，因此自动化注释至关重要。然而，目标数据集通常包含不完整参考数据集中缺失的新型细胞类型。我们提出了 scOLAR，一种由持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 一项永久展示该预印本的许可。

该预印本根据以下许可协议公开：

CC-BY 4.0 国际许可协议。

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发布于 2026 年 9 月 11 日。

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scOLAR：单细胞 RNA 测序数据的本体锚定开放集注释

Yuqiao Liu ， Siyu Yi ， Hengchuang Yin ， Wei Ju

bioRxiv 2026.09.05.749179； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.05.749179

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Yuqiao Liu ， Siyu Yi ， Hengchuang Yin ， Wei Ju

bioRxiv 2026.09.05.749179； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.05.749179

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.05.749179v1?rss=1

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