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导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMNs）是胰腺导管腺癌发生过程中经历动态上皮和间质重塑的囊性前体病变。在本研究中，我们整合计算病理学、循环免疫荧光和 Xenium 空间转录组学，以解析 IPMN 微环境的空间组织结构。我们对基于细胞的组织病理学特征进行了分析，并识别出与上皮邻近性高度相关的间质模式。循环免疫荧光和 Xenium 揭示了一个从肌成纤维细胞延伸至炎症性成纤维细胞的上皮下梯度。Xenium 进一步鉴定出肌成纤维细胞中一个独特的上皮下 NOTCH1-NESTIN 表达型成纤维细胞亚群，该亚群随肿瘤进展而扩增。通过采用人胰腺肿瘤细胞与原代肌成纤维细胞共培养模型重现这一空间重塑事件，我们证实胰腺肿瘤细胞能够诱导邻近肌成纤维细胞转变为 NESTIN 表达状态。这些发现揭示了通过上皮下 NESTIN+ 成纤维细胞介导的新型动态上皮—间质相互作用，该过程与胰腺肿瘤发生以及活性肿瘤细胞所驱动的即时微环境重塑相关，并凸显了计算病理学与空间转录组学整合应用的强大效能。
空间多组学解析上皮细胞—成纤维细胞梯度，并揭示人类胰腺肿瘤发生过程中的 NESTIN-NOTCH1 表达型上皮下成纤维细胞 | bioRxiv
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空间多组学解析上皮细胞—成纤维细胞梯度，并揭示人类胰腺肿瘤发生过程中的 NESTIN-NOTCH1 表达型上皮下成纤维细胞
Maëlle Batardiere， Myriam Iliana Ibanez-Rios， Abdelhakim Khellaf， Elham Dianati， Sarah-Slim Diwan， Maxence Pelloux， Alexandre Archambault-Marsan， Camille Beaussier， Jade Diwan， Sasha Sapon-Cousineau， Jumanah Baig， Ayman Shoukari， Zean Ghanmeh， Zhiyuan Yang， Melisa Farias Gonzalez， Jia-Lin Li， Ali Kassab， Leonardo Lando， Philippe Lefrancois， Simon Turcotte， Youngmin A Lee， Simon F Roy， Mahdi S Hosseini， Basile Tessier-Cloutier， Marcus CB Tan， Kathleen E DelGiorno， David JHF Knapp， Vincent Q Trinh
doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749182
Maëlle Batardiere¹ ¹ 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Myriam Iliana Ibanez-Rios¹ ¹ 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Abdelhakim Khellaf² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Elham Dianati² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Sarah-Slim Diwan³ ³ 麦吉尔大学健康中心研究所，麦吉尔大学，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Maxence Pelloux⁴ ⁴ 生物学与病理学研究所，格勒诺布尔—阿尔卑斯大学医院中心，法国格勒诺布尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Alexandre Archambault-Marsan⁵ ⁵ 蒙特利尔大学医院中心研究中心，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Camille Beaussier² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Jade Diwan² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Sasha Sapon-Cousineau⁵ ⁵ 蒙特利尔大学医院中心研究中心，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Jumanah Baig² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Ayman Shoukari² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Zean Ghanmeh⁶ ⁶ 计算机科学与软件工程系，康考迪亚大学，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Zhiyuan Yang⁶ ⁶ 计算机科学与软件工程系，康考迪亚大学，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Melisa Farias Gonzalez² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Jia-Lin Li² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Ali Kassab² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Leonardo Lando⁷ ⁷ 波士顿影像阅片中心，美国马萨诸塞州波士顿； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Philippe Lefrancois⁸ ⁸ 戴维斯夫人研究所，犹太综合医院，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Simon Turcotte⁵ ⁵ 蒙特利尔大学医院中心研究中心，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Youngmin A Lee⁹ ⁹ 外科系，范德比尔特大学医学中心，美国纳什维尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Simon F Roy¹⁰ ¹⁰ 罗莎琳德与莫里斯·古德曼癌症研究所，麦吉尔大学，加拿大魁北克省蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Mahdi S Hosseini⁶ ⁶ 计算机科学与软件工程系，康考迪亚大学，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Basile Tessier-Cloutier³ ³ 麦吉尔大学健康中心研究所，麦吉尔大学，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Marcus CB Tan⁹ ⁹ 外科系，范德比尔特大学医学中心，美国纳什维尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Kathleen E DelGiorno¹¹ ¹¹ 细胞与发育生物学系，范德比尔特大学，美国纳什维尔。 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
David JHF Knapp² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
Vincent Q Trinh² ² 蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所，加拿大蒙特利尔； 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站中搜索该作者
通信作者： quoc-huy.trinh{at}umontreal.ca
摘要
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摘要
导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMN）是胰腺导管腺癌的囊性前体，在进展过程中经历动态的上皮和基质重塑。本研究整合计算病理学、循环免疫荧光和 Xenium 空间转录组学，以界定 IPMN 微环境的空间组织结构。我们对基于细胞的组织病理学特征进行了分析，并识别出与上皮细胞邻近程度密切相关的基质模式。循环免疫荧光和 Xenium 揭示了一个从肌成纤维细胞延伸至炎症性成纤维细胞的上皮下梯度。Xenium 进一步在肌成纤维细胞中鉴定出一个独特的上皮下 NOTCH1-NESTIN 表达型成纤维细胞亚群，该亚群随着肿瘤进展而扩增。通过利用人胰腺肿瘤细胞与原代肌成纤维细胞共培养模型重现这一空间重塑事件，我们证实胰腺肿瘤细胞能够诱导邻近肌成纤维细胞进入 NESTIN 表达状态。这些发现揭示了与胰腺肿瘤发生相关的上皮下 NESTIN⁺ 成纤维细胞所介导的新型动态上皮—基质相互作用，以及活性肿瘤细胞对其即时微环境的重塑作用，凸显了计算病理学与空间转录组学相结合的强大能力。
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发布于 2026 年 9 月 9 日。
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Maëlle Batardiere， Myriam Iliana Ibanez-Rios， Abdelhakim Khellaf， Elham Dianati， Sarah-Slim Diwan， Maxence Pelloux， Alexandre Archambault-Marsan， Camille Beaussier， Jade Diwan， Sasha Sapon-Cousineau， Jumanah Baig， Ayman Shoukari， Zean Ghanmeh， Zhiyuan Yang， Melisa Farias Gonzalez， Jia-Lin Li， Ali Kassab， Leonardo Lando， Philippe Lefrancois， Simon Turcotte， Youngmin A Lee， Simon F Roy， Mahdi S Hosseini， Basile Tessier-Cloutier， Marcus CB Tan， Kathleen E DelGiorno， David JHF Knapp， Vincent Q Trinh
bioRxiv 2026.09.04.749182； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749182
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Maëlle Batardiere， Myriam Iliana Ibanez-Rios， Abdelhakim Khellaf， Elham Dianati， Sarah-Slim Diwan， Maxence Pelloux， Alexandre Archambault-Marsan， Camille Beaussier， Jade Diwan， Sasha Sapon-Cousineau， Jumanah Baig， Ayman Shoukari， Zean Ghanmeh， Zhiyuan Yang， Melisa Farias Gonzalez， Jia-Lin Li， Ali Kassab， Leonardo Lando， Philippe Lefrancois， Simon Turcotte， Youngmin A Lee， Simon F Roy， Mahdi S Hosseini， Basile Tessier-Cloutier， Marcus CB Tan， Kathleen E DelGiorno， David JHF Knapp， Vincent Q Trinh
bioRxiv 2026.09.04.749182； doi： https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749182
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.04.749182v1?rss=1
🏷️ 空间多组学 胰腺肿瘤微环境 成纤维细胞亚群 上皮—间质相互作用 NESTIN-NOTCH1表达 计算病理学