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理解种群的进化与分化模式对于界定保护单元和完善分类学具有重要意义。然而,当种群遗传多样性较低或彼此亲缘关系较近时,遗传分化可能难以检测,尤其是在依赖少量遗传标记的情况下。全基因组测序能够在全基因组范围内识别中性变异和离群变异,从而提高对细微种群结构的解析能力,并深入揭示相关的进化过程。在本研究中,我们利用全基因组中性变异和离群变异数据集,研究了一个近期发生分化且高度濒危的信天翁复合群——安蒂波德斯信天翁(D. antipodensis antipodensis)和吉布森信天翁(D. a. gibsoni)的基因组分化。对采自安蒂波德斯岛(安蒂波德斯信天翁)和奥克兰群岛(吉布森信天翁)的86个个体进行全基因组重测序,共鉴定出381,176个中性进化位点和57个独立分离的离群(推测具有适应性)SNP。两类数据集的分析均显示,安蒂波德斯信天翁与吉布森信天翁之间存在显著的遗传分化,不存在当代基因流动的证据,并发现了提示局部适应的选择性扫荡证据。研究还发现吉布森信天翁种群内部存在结构,不同岛屿采样地点(亚当斯岛和失望岛)之间存在遗传分化。全基因组范围内呈现的异质性分化模式表明,这两个分类群正处于不同的进化轨迹上。结合已有的形态学和行为学证据,这些基因组学结果支持重新评估它们的保护地位和分类学地位。更广泛地说,本研究证明,将中性基因组变异与推测具有适应性的基因组变异相结合,对于解析近期分化类群中的细微种群结构具有重要价值。
整合全基因组中性变异与推定适应性变异解析近期分化的信天翁复合群中的种群结构与分化 | bioRxiv
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整合全基因组中性变异与推定适应性变异解析近期分化的信天翁复合群中的种群结构与分化
查看 ORCID 个人资料 Imogen Foote , 查看 ORCID 个人资料 Tom Oosting , 查看 ORCID 个人资料 Kath Walker , 查看 ORCID 个人资料 Graeme Elliott , 查看 ORCID 个人资料 Kalinka Rexer-Huber , 查看 ORCID 个人资料 Graham C Parker , 查看 ORCID 个人资料 Geoffrey K Chambers , 查看 ORCID 个人资料 Peter A Ritchie
doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749127
Imogen Foote 1 新西兰惠灵顿维多利亚大学; 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
该文依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议公开。
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发布于2026年9月8日。
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整合全基因组中性变异与推定适应性变异解析近期分化的信天翁复合群中的种群结构与分化
Imogen Foote , Tom Oosting , Kath Walker , Graeme Elliott , Kalinka Rexer-Huber , Graham C Parker , Geoffrey K Chambers , Peter A Ritchie
bioRxiv 2026.09.04.749127; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749127
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整合全基因组中性变异与推定适应性变异解析近期分化的信天翁复合群中的种群结构与分化
Imogen Foote , Tom Oosting , Kath Walker , Graeme Elliott , Kalinka Rexer-Huber , Graham C Parker , Geoffrey K Chambers , Peter A Ritchie
bioRxiv 2026.09.04.749127; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749127
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.04.749127v1?rss=1
🏷️ 全基因组重测序 群体基因组学 种群结构 适应性分化 基因组分化 信天翁保护遗传学