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胶质瘤,尤其是胶质母细胞瘤(GBM),是一类侵袭性原发性脑肿瘤,与NLR信号失调相关;该通路在先天免疫和炎症反应中发挥核心作用。NLRP1通过自蛋白水解切割诱导促炎性细胞因子释放和细胞焦亡。FIIND结构域错义变异rs11651270(M1184V)可能调节这一切割过程。尽管NLRP1多态性与多种疾病及癌症相关,但其对胶质瘤的具体影响仍有待研究。在本研究中,采用Sanger测序方法检测胶质瘤患者临床队列中NLRP1 FIIND结构域的5个单核苷酸多态性(SNP),即rs371579423、rs58604457、rs57636751、rs11651270和rs2301583,并利用遗传关联模型,将其与GenomeIndia数据库中种群匹配的对照数据(拉贾斯坦邦队列)进行比较。通过分子动力学模拟,评估错义变异rs11651270(M1184V)在NLRP1切割前后状态下对蛋白结构的影响。连锁变异rs58604457(G>A)和rs57636751(C>T)表现出完全连锁不平衡(r²=1.00),且与较低的胶质瘤患病几率显著相关(优势比约为0.5)。错义变异rs11651270(T>C)与胶质瘤风险无显著关联。值得注意的是,尽管SNP rs2301583在GenomeIndia基于人群的对照目录中未被发现,但其在胶质瘤病例中的等位基因频率较高。分子动力学模拟显示,M1184V置换通过维持与邻近残基的持续相互作用,保持β-折叠链的组织结构,从而稳定FIIND结构域局部构象。本研究首次在印度胶质瘤患者队列中,对NLRP1 FIIND结构域变异开展了遗传学与结构学相结合的分析。这些发现表明,将基于人群的遗传关联分析与结构建模相结合,具有重要潜力,可用于提出研究假设,并揭示神经肿瘤学中炎症小体相关基因变异可能具有的功能机制。
NLRP1 FIIND结构域变异在印度人群胶质瘤中的遗传学与结构学解读:一项试点研究 | bioRxiv
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# NLRP1 FIIND结构域变异在印度人群胶质瘤中的遗传学与结构学解读:一项试点研究
查看 ORCID 个人资料 Shalini Chhipa Omkar A. Sonawane MS Revanth Deepak Kumar Jyoti Sharma Srijita Acharya Deepak Jha Sucharita Dey Pankaj Yadav 查看 ORCID 个人资料 Sushmita Jha
doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749492
Shalini Chhipa 1 印度焦特布尔理工学院; 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Shalini Chhipa 的 ORCID 记录
Omkar A. Sonawane 1 印度焦特布尔理工学院; 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
MS Revanth 1 印度焦特布尔理工学院; 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Deepak Kumar 1 印度焦特布尔理工学院; 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Jyoti Sharma 1 印度焦特布尔理工学院; 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Srijita Acharya 1 印度焦特布尔理工学院; 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Deepak Jha 2 印度焦特布尔全印度医学科学研究所 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Sucharita Dey 1 印度焦特布尔理工学院; 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Pankaj Yadav 1 印度焦特布尔理工学院; 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者
Sushmita Jha 1 印度焦特布尔理工学院; 在 Google Scholar 中查找该作者 在 PubMed 中查找该作者 在本网站搜索该作者 Sushmita Jha 的 ORCID 记录
通讯作者: sushmitajha{at}iitj.ac.in
## 摘要
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## 摘要
胶质瘤,尤其是胶质母细胞瘤(GBM),是侵袭性原发性脑肿瘤,与 NLR 信号失调相关;NLR 信号通路是先天免疫和炎症反应的核心通路。NLRP1 可通过自体蛋白水解切割触发促炎性细胞因子释放和细胞焦亡。FIIND 结构域错义变异 rs11651270(M1184V)可能调节这一切割过程。尽管 NLRP1 多态性与多种疾病及癌症相关,但其对胶质瘤的具体影响仍有待研究。在本研究中,研究人员通过 Sanger 测序检测了胶质瘤患者临床队列中 NLRP1 的 5 个 FIIND 结构域单核苷酸多态性(SNP),即 rs371579423、rs58604457、rs57636751、rs11651270 和 rs2301583,并利用遗传关联模型将其与来自 GenomeIndia 数据集(拉贾斯坦邦队列)、按人群匹配的对照组进行比较。研究人员开展了分子动力学模拟,以评估 NLRP1 错义变异 rs11651270(M1184V)在切割前和切割后状态下的结构效应。连锁变异 rs58604457(G>A)和 rs57636751(C>T)表现出完全连锁不平衡(r²=1.00),且与较低的胶质瘤患病几率显著相关(优势比约为 0.5)。错义变异 rs11651270(T>C)与胶质瘤风险无显著关联。值得注意的是,SNP rs2301583 在胶质瘤病例中的等位基因频率较高,但在 GenomeIndia 基于人群的对照目录中不存在。分子动力学模拟显示,M1184V 替换通过与邻近残基保持持续相互作用,维持 β-链的组织结构,从而稳定 FIIND 结构域的局部构象。本研究首次在印度胶质瘤队列中对 NLRP1 FIIND 结构域变异进行了遗传学与结构学相结合的分析。这些发现表明,将基于人群的遗传关联分析与结构建模相结合,可能有助于提出假设,并揭示神经肿瘤学中炎症小体基因变异的潜在功能机制。
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发布于 2026 年 9 月 8 日。
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Shalini Chhipa Omkar A. Sonawane MS Revanth Deepak Kumar Jyoti Sharma Srijita Acharya Deepak Jha Sucharita Dey Pankaj Yadav Sushmita Jha
bioRxiv 2026.09.04.749492; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749492
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Shalini Chhipa Omkar A. Sonawane MS Revanth Deepak Kumar Jyoti Sharma Srijita Acharya Deepak Jha Sucharita Dey Pankaj Yadav Sushmita Jha
bioRxiv 2026.09.04.749492; doi: https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749492
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.04.749492v1?rss=1
🏷️ 胶质瘤 NLRP1炎症小体 FIIND结构域变异 遗传关联分析 分子动力学模拟