CAMOR及特定癌基因驱动的长链非编码RNA在MYC、突变型KRAS和突变型TP53下游介导致癌功能

root 提交于 周三, 09/09/2026 - 00:47
目的 长链非编码RNA(lncRNA)是肿瘤生物学的重要调控因子,但其对主要致癌驱动因素的依赖性及癌症特异性仍缺乏充分表征。本研究旨在识别结直肠癌、肺癌和胰腺癌中受MYC、突变型KRAS和突变型TP53调控的lncRNA,并确定其功能相关性及分子机制。 方法 我们对结直肠癌、肺癌和胰腺癌细胞系中由MYC、突变型KRAS和突变型TP53驱动的lncRNA表达谱进行了整合分析。通过检测癌细胞活力、迁移能力和克隆形成能力,对候选lncRNA进行了功能表征。同时,研究了其在患者来源肿瘤组织和正常组织中的表达,以及下游分子通路。 结果 MYC与最广泛的lncRNA调控相关,其表达模式在很大程度上不依赖于组织来源。依赖MYC的LINC00997和此前未被表征的AC104447.1,以及特异性依赖KRAS的RAKRAR(RASSF3反义KRAS调控lncRNA),均可促进癌细胞活力、迁移能力和克隆形成能力。与正常组织相比,LINC00997和AC104447.1在特定肿瘤类型中的表达升高。我们鉴定出CAMOR(CARNMT1反义多癌蛋白调控lncRNA),这是一种可被三种致癌驱动因素共同上调的泛癌lncRNA。在所分析的细胞系和肿瘤类型中,CAMOR可特异性促进癌细胞的活力和迁移能力。从机制上看,CAMOR与其邻近基因CARNMT1形成负反馈调控环,影响CAMOR的致癌活性。不同的下游基因表达特征表明,所研究的lncRNA可能通过不同的调控过程发挥作用。 结论 本研究拓展了致癌性lncRNA的谱系,并证明整合多种致癌背景能够识别出具有驱动因素特异性以及广泛作用的lncRNA,为鉴定可能参与癌症发生发展并具有潜在诊断或治疗靶点价值的lncRNA提供了研究框架。

CAMOR及特定癌基因驱动的lncRNA介导MYC、突变型KRAS和突变型TP53下游的致癌功能 | bioRxiv

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CAMOR及特定癌基因驱动的lncRNA介导MYC、突变型KRAS和突变型TP53下游的致癌功能

Maria Grzes,

Akanksha Jaiswar,

Wojciech Kazmierczak,

Tomasz Olesinski,

Magdalena Nowak-Niezgoda,

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Dawid Walerych

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749381

Maria Grzes 1 波兰华沙Mossakowski医学研究所(波兰科学院);

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通讯作者:

mgrzes{at}imdik.pan.pl

Akanksha Jaiswar 1 波兰华沙Mossakowski医学研究所(波兰科学院);

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Wojciech Kazmierczak 2 波兰华沙Maria Sklodowska-Curie国家肿瘤研究所;

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Tomasz Olesinski 2 波兰华沙Maria Sklodowska-Curie国家肿瘤研究所;

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Magdalena Nowak-Niezgoda 3 波兰华沙内政与行政部国家医学研究所;

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Dawid Walerych 4 Mossakowski医学研究所

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研究目的

长链非编码RNA(lncRNA)是肿瘤生物学的重要调控因子,但其对主要致癌驱动因子的依赖性及癌症特异性仍缺乏充分表征。本研究旨在鉴定结直肠癌、肺癌和胰腺癌中受MYC、突变型KRAS和突变型TP53调控的lncRNA,并确定其功能相关性及分子机制。

方法

我们对结直肠癌、肺癌和胰腺癌细胞系中由MYC、突变型KRAS和突变型TP53驱动的lncRNA表达谱进行了整合分析。通过癌细胞存活、迁移和克隆形成实验,对候选lncRNA进行了功能表征。进一步研究了其在患者来源肿瘤组织和正常组织中的表达,以及其下游分子通路。

结果

MYC与最广泛的lncRNA调控相关,其表达模式在很大程度上不依赖于组织来源。依赖MYC的LINC00997和此前尚未表征的AC104447.1,以及特异性依赖KRAS的RAKRAR(RASSF3反义KRAS调控lncRNA),均促进癌细胞存活、迁移和克隆形成。与正常组织相比,LINC00997和AC104447.1在特定肿瘤类型中的表达升高。我们鉴定出CAMOR(CARNMT1反义多癌蛋白调控lncRNA),这是一种由上述三种致癌驱动因子共同上调的泛癌症lncRNA。在所分析的细胞系和肿瘤类型中,CAMOR特异性地促进癌细胞的存活和迁移。机制研究表明,CAMOR及其邻近基因CARNMT1形成负反馈调控环,从而影响CAMOR的致癌活性。不同的下游基因表达特征提示,所研究的lncRNA通过不同的调控过程发挥作用。

结论

我们的研究扩展了致癌性lncRNA的谱系,并证明整合多种致癌背景能够鉴定出驱动因子特异性lncRNA和具有广泛作用的lncRNA,为识别可能参与癌症发生并具有潜在诊断或治疗靶点价值的lncRNA提供了一个框架。

利益冲突声明

基金信息声明

国家科学中心,

Sonata Bis项目,编号2017/26/E/NZ5/00663,

Opus项目,编号2022/45/B/NZ5/04189,

Miniatura项目,编号2022/06/X/NZ5/01730

版权

本预印本的。

本文依据

CC-BY 4.0国际许可协议

公开发布。

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发布于2026年9月8日。

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Maria Grzes,

Akanksha Jaiswar,

Wojciech Kazmierczak,

Tomasz Olesinski,

Magdalena Nowak-Niezgoda,

Dawid Walerych

bioRxiv

2026.09.04.749381;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749381

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CAMOR及特定癌基因驱动的lncRNA介导MYC、突变型KRAS和突变型TP53下游的致癌功能

Maria Grzes,

Akanksha Jaiswar,

Wojciech Kazmierczak,

Tomasz Olesinski,

Magdalena Nowak-Niezgoda,

Dawid Walerych

bioRxiv

2026.09.04.749381;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.09.04.749381


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.04.749381v1?rss=1

🏷️ 长链非编码RNA 癌基因驱动 结直肠癌 肺癌 胰腺癌 肿瘤分子机制