PromptBio：一个用于端到端计算生物医学研究的智能体平台

现代生物医学研究日益依赖复杂的计算分析，然而，将科学问题转化为可靠的工作流程仍需要大量技术专长与人工协调。PromptBio 是一个多智能体人工智能平台，可通过网页门户 https://promptbio.ai 使用，旨在应对这一挑战。借助自然语言交互，其智能体框架 PromptGenie 能够将研究目标转化为可检查的计划，执行所需的研究与分析，并随着证据和结果的出现动态调整后续步骤。PromptBio 将推理与受控执行相结合，同时保留人工监督机制以及可追溯的研究过程记录。该平台既能够应用经过验证的方法、构建定制化分析，也能够整合外部工作流程，使研究人员得以突破固定流程的限制，同时支持研究的可重复性。 我们通过端到端生物信息学分析和生物医学深度研究基准测试、对代表性组学与机器学习技能的验证，以及一项由假设驱动的调控基因组学案例研究，对该平台进行了评估。与对比智能体相比，PromptGenie 在分析准确性、证据检索与综合能力方面表现更优；经评估的领域技能所产生的结果也与既有方法相一致。该案例研究进一步展示了 PromptBio 如何整合人类特异性的基因组与表观基因组特征，以探究皮层发育。总体而言，这些发现表明，PromptBio 能够在研究人员监督下协调复杂的生物医学分析，为加速科学迭代、将研究问题转化为透明且可复用的计算工作流程提供了一种易于使用的方法。

现代生物医学研究日益依赖复杂的计算分析，然而，将科学问题转化为可靠的工作流程仍需要大量的技术专长和人工协调。PromptBio 是一个多智能体人工智能平台，可通过 https://promptbio.ai 访问，旨在应对这一挑战。通过自然语言交互，其智能体框架 PromptGenie 能够将研究目标转化为可检查的计划，执行所需的研究与分析，并随着证据和结果的出现调整后续步骤。PromptBio 将推理与受管理的执行相结合，同时保留人工监督以及可追溯的研究过程记录。该平台能够应用经过验证的方法、构建定制化分析并整合外部工作流程，使研究人员得以超越固定流程，同时支持研究的可重复性。

我们通过端到端生物信息学分析和生物医学深度研究基准测试、对具有代表性的组学与机器学习技能进行验证，以及一项以假设为驱动的调控基因组学案例研究，对该平台进行了评估。与对比智能体相比，PromptGenie 实现了更高的分析准确性以及更强的证据检索与综合能力；经评估的领域技能所产生的结果也与既有方法一致。该案例研究进一步展示了 PromptBio 如何整合人类特异性的基因组和表观基因组特征，以探究皮层发育。总体而言，这些研究结果表明，PromptBio 能够在研究人员监督下协调复杂的生物医学分析，为加速科学迭代、并将研究问题转化为透明且可复用的计算工作流程，提供了一种易于使用的方法。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.02.748774v1?rss=1

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