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许多植物基因组庞大且含有大量重复序列,这阻碍了人们阐明进化的基本过程如何促成物种形成。在此,我们展示了四种亲缘关系密切的福禄考属野花植物的染色体水平组装基因组,其基因组大小均约为6 Gb。我们针对三种研究较为充分的一年生植物物种——*P. drummondii*、*P. cuspidata*和*P. roemeriana*——获取了大量群体遗传学数据,其中包括基于全基因组长读长重测序数据鉴定的结构变异。全基因组组装结果揭示了物种内及物种间遗传变异数量和分布的广泛差异,这些差异反映了它们在生活史策略、交配系统和土壤生态专化方面的不同。群体遗传学数据揭示,在三种一年生福禄考属植物分化并形成物种的整个过程中,它们之间一直存在广泛且持续的基因流。通过揭示结构变异和重复元件,我们发现了丰富且动态的遗传变异形式;这些变异表现出强烈的系统发育信号以及普遍存在的基因流模式。我们的研究为解析植物高度复杂的基因组奠定了基础,从而推动我们对物种形成与分化过程的理解。
许多植物基因组规模庞大且含有大量重复序列,这阻碍了人们阐明进化的基本过程如何导致物种形成。在此,我们展示了四种亲缘关系密切的福禄考属野花植物的染色体水平组装基因组,其大小均为6 Gb。我们为研究较为充分的三种一年生物种——福禄考(P. drummondii)、尖叶福禄考(P. cuspidata)和罗默里安娜福禄考(P. roemeriana)——获取了广泛的群体遗传学数据,其中包括基于全基因组长读长重测序数据获得的结构变异。全基因组组装结果揭示了物种内和物种间遗传变异的数量及分布存在广泛差异,这些差异反映了其生活史策略、交配系统和土壤条件专化方面的不同。群体遗传学数据揭示,在三种一年生福禄考物种分化并形成新物种的整个过程中,它们之间始终存在广泛且持续的基因流。我们对结构变异和重复元件的揭示,展现了丰富且动态的遗传变异形式;这些变异表现出明显的系统发育信号以及普遍存在的基因流模式。我们的研究为解析植物高度复杂的基因组奠定了基础,并将推动我们对物种形成与分化过程的认识。
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.01.748350v1?rss=1
🏷️ 福禄考属植物 复杂基因组 结构变异 基因流 物种形成 群体遗传学
来源出处
揭示福禄考庞大且高度重复的基因组,展现了伴随基因流的复杂物种形成演化历史
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.01.748350v1?rss=1