- 3 次围观
登革病毒（DENV）是全球主要的公共卫生威胁之一，可引发登革热，主要影响热带和亚热带地区。DENV的NS2B-NS3蛋白酶复合物对病毒复制至关重要，因此成为抗病毒药物开发的一个有前景的靶点。本研究结合实验与计算方法，探究了不同pH条件下NS2B-NS3蛋白酶的结构动态。重组NS2B-NS3蛋白酶在大肠杆菌（E. coli）中表达，经亲和层析纯化，并通过SDS-PAGE分析其纯度。圆二色（CD）光谱显示出依赖于pH的二级结构变化，表明该蛋白酶在中性至弱碱性pH条件下具有良好的稳定性，而在酸性和强碱性条件下发生 destabilization。动态光散射（DLS）分析表明，在极端pH条件下，蛋白质会发生聚集并表现出结构异质性。互补性的计算机模拟技术，包括同源建模和分子动力学（MD）模拟，为蛋白酶的构象变化提供了详细的认识。经计算工具验证和优化后的模型结构显示，该蛋白酶在生理pH条件下具有结构稳定性，而在极端pH条件下则出现显著破坏。DSSP（蛋白质二级结构字典）分析和主成分分析突出了显著的二级结构转变，尤其是在酸性pH条件下，α-螺旋和β-折叠转变为无规卷曲。针对登革病毒NS2B-NS3与小分子之间的相互作用，开展了对接和分子动力学模拟，以进行治疗学分析。本研究强调了NS2B-NS3蛋白酶依赖于pH的构象可塑性，有助于理解其功能机制，并为理性设计pH特异性抑制剂奠定基础。这些发现凸显了结构生物学在推进登革热治疗策略方面的重要性。
登革病毒（DENV）是全球主要的公共卫生威胁之一，可引发登革热，主要影响热带和亚热带地区。DENV 的 NS2B-NS3 蛋白酶复合物对病毒复制至关重要，因此成为抗病毒药物开发的理想靶点。本研究结合实验与计算方法，探讨了不同 pH 条件下 NS2B-NS3 蛋白酶的结构动态变化。重组 NS2B-NS3 蛋白酶在大肠杆菌（E. coli）中表达，经亲和层析纯化，并通过 SDS-PAGE 分析其纯度。圆二色谱（CD）光谱显示，该蛋白的二级结构发生了 pH 依赖性变化，表明其在中性至弱碱性条件下较为稳定，而在酸性及强碱性条件下发生 destabilization。动态光散射（DLS）分析表明，在极端 pH 条件下，蛋白出现聚集及结构异质性。包括同源建模和分子动力学（MD）模拟在内的互补性计算方法，为深入揭示该蛋白酶的构象变化提供了详细信息。经计算工具验证和优化后的模型结构显示，该蛋白酶在生理 pH 条件下具有较高的结构稳定性，而在极端 pH 条件下则出现显著的结构破坏。DSSP（蛋白质二级结构字典）分析和主成分分析突出显示了显著的二级结构转变，尤其是在酸性 pH 条件下，α-螺旋和 β-折叠转变为无规卷曲。针对登革病毒 NS2B-NS3 蛋白酶与小分子化合物开展了分子对接和分子动力学模拟，以进行治疗潜力分析。本研究强调了 NS2B-NS3 蛋白酶具有 pH 依赖性的构象可塑性，有助于理解其功能机制，并为理性设计 pH 特异性抑制剂奠定基础。这些发现凸显了结构生物学在推进登革热治疗策略方面的重要作用。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.02.748787v1?rss=1
🏷️ 登革病毒 NS2B-NS3蛋白酶 结构动力学 分子动力学模拟 蛋白质构象变化 抗病毒药物设计