依赖度量指标的基因组多样性揭示了腐木甲虫的系统发育与生态结构

摘要 1. 当基因组多样性指标采用不同分母时，比较研究可能得出不同结论。 2. 我们分析了来自波兰八个森林复合体的标准化 ddRAD-seq 数据，包括759个个体、149条物种—地点种群记录以及26种腐木甲虫。 3. 物种身份和采样层级解释了种群水平变异中的大部分。与落叶树相关的物种，其变异位点期望杂合度高于与针叶树相关的物种。 4. 全位点核苷酸多样性表现出稳定的系统发育信号，而出现层级以及探索性的森林经营和保护状况对比均未显示出一致的关联。 5. 基因组多样性指标并非可以相互替代；比较评估应报告其分母，并检验其对谱系的敏感性。

摘要

1. 当基因组多样性指标采用不同分母时，比较研究可能得出不同结论。 2. 我们分析了来自波兰八个森林复合体的759个个体、149条“物种–地点”种群记录以及26种腐木甲虫的标准化ddRAD-seq数据。 3. 物种身份和采样层级解释了种群水平变异的大部分。与针叶树相关的物种相比，与阔叶树相关的物种具有更高的变异位点期望杂合度。 4. 全位点核苷酸多样性表现出稳定的系统发育信号，而出现层级以及探索性的森林经营和保护对比均未显示出一致的关联。 5. 基因组多样性指标不可相互替代；比较评估应报告其分母，并检验谱系敏感性。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.30.748084v1?rss=1

🏷️ 基因组多样性 系统发育 ddRAD测序 腐木甲虫 群体遗传结构 生态基因组学