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一种革兰氏染色阴性、好氧、中度嗜盐、无运动性、杆状细菌，命名为 MC10-B4^T，分离自采集于香港水域的鹿角珊瑚（*Oulastrea crispata*）。在一项为期8个月的野外试验监测期间，该菌株表现出在珊瑚全生物体中持续存在的能力，表明其与珊瑚宿主之间存在长期关联。在标准实验室条件下，该菌株可在10–37 ℃（最适温度为28–30 ℃）、NaCl浓度不高于4.0%（w/v；最适浓度为0.5–2.0%）以及pH 7.0–10.0（最适pH为7.0–8.0）条件下生长。在Marine Agar 2216培养基上，菌落呈圆形、光滑、凸起、白色、不透明，边缘整齐。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明，菌株MC10-B4^T属于Ruegeria属，与Ruegeria conchae TW15^T的序列相似性最高（99.64%），其次分别为Ruegeria profundi ZGT108^T（98.92%）、Ruegeria lacuscaerulensis ITI-1157^T（98.46%）、Ruegeria denitrificans CECT 5091^T（98.31%）、Ruegeria arenilitoris G-M8^T（97.69%）、Ruegeria atlantica NBRC 15792^T（97.55%）、Ruegeria halocynthiae MA1-6（97.11%）、Ruegeria atlantica IAM 14463^T（96.98%）、Ruegeria meonggei MA-E2-3（96.83%）和Ruegeria pomeroyi DSS-3^T（96.65%）。基因组测序显示，该菌株的基因组大小为4.55 Mbp，DNA G+C含量为57.5 mol%。菌株MC10-B4^T与Ruegeria conchae TW15^T之间的平均核苷酸一致性（ANI）和数字DNA-DNA杂交（dDDH）值分别为77.6%和18.2–22.8%。这些数值均低于物种划分的推荐阈值（分别为95%和70%）。菌株MC10-B4^T与其他Ruegeria菌株具有相同的主要脂肪酸，即总特征8（由C18:1 ω7c和/或C18:1 ω6c组成）；然而，该菌株还含有C19:0 cyclo ω8c，而在Ruegeria conchae TW15^T和Ruegeria pomeroyi DSS-3^T中未检测到该脂肪酸。模式菌株为MC10-B4^T（= GDMCC 1.6889^T = KCTC 18785^T）。
一种革兰氏染色阴性、好氧、中度嗜盐、无运动性、杆状细菌，编号为 MC10-B4^T，从采自香港水域的扁平蜂巢珊瑚（Oulastrea crispata）中分离获得。在一次为期8个月的野外试验监测期间，该菌株表现出能够持续存在于珊瑚全生物体中的能力，表明其与珊瑚宿主存在长期关联。在标准实验室条件下，该菌株可在10–37 ℃（最适温度为28–30 ℃）、NaCl浓度最高达4.0%（w/v；最适浓度为0.5–2.0%）以及pH 7.0–10.0（最适pH为7.0–8.0）的条件下生长。在Marine Agar 2216培养基上，菌落呈圆形、光滑、凸起、白色、不透明，边缘整齐。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明，菌株MC10-B4^T属于Ruegeria属，与Ruegeria conchae TW15^T的序列相似性最高（99.64%），其次分别为Ruegeria profundi ZGT108^T（98.92%）、Ruegeria lacuscaerulensis ITI-1157^T（98.46%）、Ruegeria denitrificans CECT 5091^T（98.31%）、Ruegeria arenilitoris G-M8^T（97.69%）、Ruegeria atlantica NBRC 15792^T（97.55%）、Ruegeria halocynthiae MA1-6（97.11%）、Ruegeria atlantica IAM 14463^T（96.98%）、Ruegeria meonggei MA-E2-3（96.83%）和Ruegeria pomeroyi DSS-3^T（96.65%）。基因组测序显示，该菌株的基因组大小为4.55 Mbp，DNA G+C含量为57.5 mol%。菌株MC10-B4^T与Ruegeria conchae TW15^T之间的平均核苷酸一致性和数字DNA-DNA杂交值分别为77.6%和18.2–22.8%。这些数值均低于物种划分的推荐阈值（分别为95%和70%）。菌株MC10-B4^T与其他Ruegeria属菌株具有相同的主要脂肪酸，即总特征8（由C18:1 ω7c和/或C18:1 ω6c组成）；然而，该菌株还含有C19:0 cyclo ω8c，而在Ruegeria conchae TW15^T和Ruegeria pomeroyi DSS-3^T中未检测到该脂肪酸。模式菌株为MC10-B4^T（= GDMCC 1.6889^T = KCTC 18785^T）。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.01.748717v1?rss=1
🏷️ 珊瑚共生菌 Ruegeria属 新物种鉴定 细菌分类学 系统发育分析 基因组学