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蛋白质棕榈酰化是一种动态且可逆的翻译后脂质修饰，其在癌症及一系列人类疾病中的病理生理学意义正日益受到重视。然而，现有数据库主要收录来源于零散文献报道的棕榈酰化位点，并且在公开可用的基于质谱（MS）的棕榈酰化组数据集之间明显缺乏系统性整合与标准化，这严重阻碍了规范化注释及跨队列比较分析。在此，我们介绍PalmLab——一个综合性计算平台，通过将基于MS的棕榈酰化组数据整理与交互式、多维度分析功能有机结合，为人类和小鼠蛋白质组提供协同分析。借助统一且经过严格标准化的生物信息学流程，PalmLab能够对所有已发表的棕榈酰化组数据集进行系统性再分析，构建出包含15,968种人源和9,924种小鼠经MS验证的棕榈酰化蛋白的整理汇编，使现有条目总数增加一倍以上，显著超过现有公共数据库中的收录规模。该平台还提供用户友好、无需编程的分析模块，支持差异性棕榈酰化谱分析、情境特异性模式可视化、蛋白质—蛋白质相关性网络推断、突变—棕榈酰化关联图谱构建以及基于序列的基序发现。总体而言，PalmLab构成了一个全面且开放获取的资源，可用于系统性挖掘棕榈酰化组并对棕榈酰化事件开展功能解析，从而推动阐明棕榈酰化介导的调控回路，并助力肿瘤学领域新型治疗靶点的优先筛选。该平台可通过https://palmlab.intelligent-oncology.com免费访问。
蛋白质棕榈酰化是一种动态且可逆的翻译后脂质修饰，其在癌症及一系列人类疾病中的病理生理学意义正日益受到重视。然而，当前数据库主要收录源自零散文献报道的棕榈酰化位点，并且在公开可用的基于质谱（MS）的棕榈酰化蛋白质组数据集之间明显缺乏系统性整合与标准化，这严重阻碍了规范化注释和跨队列比较分析。在此，我们推出 PalmLab，这是一个综合性计算平台，将基于 MS 的棕榈酰化蛋白质组数据整理与面向人和小鼠蛋白质组的交互式、多维度分析功能有机结合。通过统一且严格标准化的生物信息学流程，PalmLab 实现了对所有已发表棕榈酰化蛋白质组数据集的系统性再分析，建立了一个经 MS 验证的棕榈酰化蛋白质数据库，其中包含 15,968 个人源蛋白和 9,924 个小鼠源蛋白；与现有公共数据库中的条目总数相比，数据规模增加了一倍以上。该平台还提供便捷、无需编程的分析模块，支持差异性棕榈酰化谱分析、情境特异性模式可视化、蛋白质-蛋白质相关网络推断、突变-棕榈酰化关联映射以及基于序列的基序发现。总体而言，PalmLab 构成了一个全面且开放获取的资源，可用于系统性挖掘棕榈酰化蛋白质组并对棕榈酰化事件开展功能性解析，从而促进棕榈酰化介导的调控网络的阐明，并助力肿瘤学领域新型治疗靶点的优先筛选。该平台可通过 https://palmlab.intelligent-oncology.com 免费访问。
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