肠道菌群决定小鼠艰难梭菌感染模型中不同供应商来源的差异

艰难梭菌感染（Clostridioides difficile infection，CDI）是医疗保健相关感染性腹泻的首要原因，至今仍给全球医疗卫生系统带来沉重负担。CDI新型治疗方法的开发需要稳健且具有良好重复性的临床前模型。然而，肠道微生物群已成为动物研究中变异性的主要来源。我们发现，从两家商业供应商——Jackson Laboratory（JAX）和Charles River Laboratories（CRL）——获得的遗传背景相近的小鼠对CDI表现出显著不同的易感性：JAX小鼠发展为暴发性疾病，而CRL小鼠则保持抵抗性。通过全长16S rRNA基因测序，我们显示JAX小鼠和CRL小鼠具有不同的肠道微生物群；此外，将易感的JAX小鼠与具有抵抗性的CRL小鼠合笼，足以使JAX小鼠的微生物群向CRL小鼠的群落结构转变，并赋予其对CDI的抵抗性。差异丰度分析鉴定出可区分具有抵抗性和易感性小鼠的分类群，为未来的机制研究提供了候选对象。这些发现表明，供应商来源导致的肠道微生物群差异驱动了小鼠对CDI的不同易感性，且该表型可通过合笼实现转移，凸显了在设计和解读感染性疾病动物模型时考虑肠道微生物群的重要性。

艰难梭菌感染（Clostridioides difficile infection，CDI）是医疗相关性传染性腹泻的首要病因，并且仍然给全球医疗卫生系统带来沉重负担。CDI新型治疗手段的开发需要稳健且具有良好重复性的临床前模型。然而，微生物群已成为动物研究中变异性的主要来源。在本研究中，我们发现，从两家商业供应商——Jackson Laboratory（JAX）和Charles River Laboratories（CRL）——获得的遗传学相近小鼠对CDI的易感性存在显著差异：JAX小鼠出现暴发性疾病，而CRL小鼠则保持抵抗性。通过全长16S rRNA基因测序，我们证实JAX小鼠和CRL小鼠具有不同的肠道微生物群；此外，将易感的JAX小鼠与具有抵抗性的CRL小鼠共同饲养，足以使JAX小鼠的微生物群结构向CRL群落结构转变，并赋予其对CDI的抵抗性。差异丰度分析鉴定出可区分具有抵抗性和易感性小鼠的分类群，为未来的机制研究提供了候选对象。这些发现表明，供应商来源导致的肠道微生物群差异驱动了小鼠对CDI的不同易感性，并且这种表型可通过共同饲养实现转移，凸显了在设计和解读传染病动物模型时考虑微生物群的重要性。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.31.748273v1?rss=1

🏷️ 肠道菌群 艰难梭菌感染 小鼠感染模型 16S rRNA测序 微生物群移植 疾病易感性