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代谢功能障碍相关脂肪性肝病（metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease，MASLD）是全球慢性肝脏疾病的首要病因，正日益成为沉重的临床负担。目前，其诊断仍依赖肝活检，这限制了疾病的早期检测，也难以捕捉疾病进展过程中发生的分子变化。系统阐明依赖疾病分期的基因表达变化，对于识别生物标志物并有效解析疾病机制至关重要。因此，近期研究提供了用于基因检索的数据库，并预测了用于疾病进展评估的多基因特征。然而，对于具有可用组织学元数据的MASLD患者数据集，仍需要开展交互式且全面的荟萃分析。在本研究中，我们利用非酒精性脂肪性肝病活动度评分（NAFLD Activity Score，NAS；n = 897）和纤维化分期数据（n = 856），对RNA测序数据集进行了荟萃分析，并对不同组织学分期进行了成对比较，从而鉴定出与疾病进展相关的差异表达基因。最重要的是，我们通过专用网络服务器MASLD-META NETWORK（https://masld.scilicium.com）提供了研究结果，使用户能够以交互方式探索不同网络模式下的荟萃分析结果。此外，我们刻画了随疾病分期逐渐加重而发生的基因表达动态变化，并利用Louvain聚类识别出与疾病进展一致相关的通路。基于网络的参数（如中心性）与荟萃分析评分相结合，进一步凸显了参与疾病机制的核心基因和通路。基于此，MASLD-META NETWORK对近期发表的基因特征进行了整合性再评估，鉴定出COL1A1、COL3A1、THBS2、FBLN5和PDGFA为中心性最高的基因，并将SULF2、MMP14、IL32、GPNMB和COL3A1确定为早期转录变化的候选标志物。对MASLD相关生物学模块的网络分析进一步鉴定出LAMA2和LAMA3，提示其可能是此前尚未被识别的核心候选靶点。
代谢功能障碍相关脂肪性肝病（metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease，MASLD）是全球慢性肝脏病变的首要病因，正日益成为沉重的临床负担。目前，其诊断仍依赖肝活检，这限制了疾病的早期检测以及对疾病进展过程中分子变化的捕捉。系统理解阶段依赖性的基因表达变化，对于识别生物标志物并有效解析疾病机制至关重要。因此，近期研究已建立用于基因检索的数据库，并对疾病进展相关的多基因特征进行了预测。然而，对于具有可用组织学元数据的MASLD患者数据集，仍需要开展交互式且全面的荟萃分析。在本研究中，我们基于非酒精性脂肪性肝病活动度评分（NAFLD Activity Score，NAS；n = 897）和纤维化分期（n = 856）的RNA测序数据集进行荟萃分析，通过对不同组织学阶段开展成对比较，鉴定出与疾病进展相关的差异表达基因。最为重要的是，我们通过专门构建的网络服务器MASLD-META NETWORK（https://masld.scilicium.com）提供了研究结果，使用户能够以交互方式探索不同网络模式下的荟萃分析结果。此外，我们刻画了随疾病分期加重而发生的基因表达动态变化，并利用Louvain聚类识别出与疾病进展一致相关的通路。基于网络的参数（如中心性）结合荟萃分析评分，进一步突出显示了参与疾病机制的核心基因和通路。基于此，MASLD-META NETWORK对近期发表的基因特征进行了整合性再评估，鉴定出COL1A1、COL3A1、THBS2、FBLN5和PDGFA为中心性最高的基因，并将SULF2、MMP14、IL32、GPNMB和COL3A1确定为较早期转录改变的候选标志物。对MASLD相关生物学模块开展网络分析后，进一步发现LAMA2和LAMA3是此前尚未被识别的核心候选靶点。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.26.747338v1?rss=1
🏷️ 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 网络荟萃分析 RNA测序 差异表达基因 疾病进展生物标志物 基因调控网络