早期后生动物的RNA病毒组揭示了病毒与宿主的长期关系

root 提交于 周二, 09/01/2026 - 18:47
栉水母动物和扁盘动物在后生动物演化早期出现,其特征与动物演化的关键方面相关。尽管栉水母动物和扁盘动物具有重要的演化意义,但人们对其RNA病毒组的了解仍十分有限。为确定这些生物中RNA病毒组的多样性和演化历史,尤其是探究与这些古老宿主谱系共存的病毒是否同样占据系统发育基部位置,我们分析了序列读取档案库(Sequence Read Archive,SRA)中公开可用的转录组数据。通过分析,我们鉴定出26种推定的新型病毒,归属于11个病毒类群,其中包括黄病毒科(Flaviviridae)和Chuviridae科的成员。这些新型病毒与此前在脊椎动物、无脊椎动物、植物和真菌中鉴定的病毒聚类。值得注意的是,黄病毒科、Chuviridae科、Lispiviridae科和Marnaviridae科中的部分病毒序列具有高度分化特征:相较于其最近的已知亲缘类群,它们在系统发育树上呈深分支,或形成独立谱系;在某些情况下,这提示其可能在后生动物演化早期便已发生分化。相比之下,Birnaviridae科、Endornaviridae科、Mymonaviridae科、Narnaviridae科、Phasmaviridae科、Orthomyxoviridae科、Orthototiviridae科中的病毒,以及Picornavirales目中的部分病毒,则表现出与较近时期的多样化和宿主跳跃相一致的模式。此外,在栉水母动物门的多个物种和组织中(包括完整个体和胚胎),以及扁盘动物中,均检测到RNA病毒,从而拓展了这些病毒的宿主范围,并凸显出其中大量尚未被表征的多样性。总体而言,这些发现拓展了若干病毒类群已知的多样性和宿主范围,阐明了早期后生动物中的病毒演化,揭示了水生环境中的宿主跳跃现象,以及可能贯穿整个动物演化历程的病毒—宿主关联。

栉水母和扁盘动物在后生动物演化早期便已出现,其特征是具有与动物演化关键方面相关的性状。尽管栉水母和扁盘动物具有重要的演化意义,但人们对其RNA病毒组的了解仍十分有限。为确定这些生物中RNA病毒组的多样性与演化,尤其是探究与这些古老宿主谱系共存的病毒是否同样占据系统发育上的基部位置,我们分析了序列读取档案(Sequence Read Archive,SRA)中公开可用的转录组数据。由此,我们鉴定出26种推定的新型病毒,归属于11个病毒类群,其中包括黄病毒科(Flaviviridae)和楚病毒科(Chuviridae)的成员。这些新型病毒与此前在脊椎动物、无脊椎动物、植物和真菌中鉴定出的病毒聚类。值得注意的是,黄病毒科、楚病毒科、Lispiviridae和玛纳病毒科(Marnaviridae)中的一些病毒序列具有高度分化特征:相较于其最近的已知亲缘类群,它们表现出深分支,或形成独立谱系;在某些情况下,这提示其可能在后生动物演化早期便已发生分化。相比之下,双RNA病毒科(Birnaviridae)、内源RNA病毒科(Endornaviridae)、Mymonaviridae、纳尔纳病毒科(Narnaviridae)、Phasmaviridae、正黏病毒科(Orthomyxoviridae)、Orthototiviridae中的病毒,以及小RNA病毒目(Picornavirales)中的部分病毒,则呈现出与较近时期的多样化和宿主跳跃相一致的模式。此外,在栉水母动物门的多个物种和组织中(包括完整个体和胚胎),以及在扁盘动物中,均检测到了RNA病毒,从而扩大了这些病毒的已知宿主范围,并凸显出其中大量尚未被表征的多样性。总体而言,这些发现扩展了多个病毒类群已知的多样性和宿主范围,揭示了早期后生动物中的病毒演化,并表明水生环境中既存在宿主跳跃,也存在可能贯穿整个动物演化历程的病毒—宿主关联。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.30.748148v1?rss=1

🏷️ RNA病毒组 早期后生动物 病毒-宿主共演化 病毒系统发育 宿主跳跃 宏转录组分析