核质病毒门Megaviricetes纲中拟议新目Ariadnavirales向依赖细胞核复制转变过程中伴随的复制与转录系统丧失

Sicyoidochytrium minutum DNA病毒（SmDNAV）数年前从网黏菌纲（Labyrinthulomycetes）破囊壶菌科（Thraustochytriaceae）的一种原生生物宿主中分离获得。该病毒在基因组成和蛋白质序列方面与其他病毒几乎没有相似性，尽管它似乎属于核质巨DNA病毒门（Nucleocytoviricota）。通过对基因组和宏基因组序列数据库进行广泛检索，我们鉴定出大量与SmDNAV基因组相关的长重叠群，并分析了这些推定病毒之间共有的蛋白质。系统发育分析表明，这些病毒属于巨病毒纲（Megaviricetes），位于所有已建立的病毒目之外，并且是由Mamonoviridae科和Manesviridae科组成的类群的姐妹群。SmDNAV蛋白的同源物被发现与来自多种海洋和淡水环境的其他网黏菌纲及红藻门（Rhodophyta）原生生物相关联（或整合其中，或与其共同测序）。因此，我们提出将SmDNAV作为巨病毒纲、核质巨DNA病毒门内一个新目的模式成员，并暂命名为Ariadnavirales目。Ariadnavirales目的成员已经丢失了大多数编码复制和转录系统组分的基因，而这些组分通常在核质巨DNA病毒类群中是保守的，这表明其基因组复制和表达可能已经转变为依赖宿主细胞核。

数年前，研究人员从网藻菌纲（Labyrinthulomycetes）破囊壶菌科（Thraustochytriaceae）的一种原生生物宿主中分离出小型西科伊多壶菌DNA病毒（Sicyoidochytrium minutum DNA virus，SmDNAV）。该病毒在基因组成和蛋白质序列方面与其他病毒的相似性均很低，尽管其似乎属于核质巨DNA病毒门（Nucleocytoviricota）。通过对基因组和宏基因组序列数据库进行广泛检索，我们鉴定出大量与SmDNAV基因组相关的长重叠群，并分析了这些推定病毒所共有的蛋白质。系统发育分析表明，这些病毒属于巨型病毒纲（Megaviricetes），位于所有已建立的目之外，并且是由Mamonoviridae科和Manesviridae科组成的分支的姐妹群。在来自多种海洋和淡水环境的其他网藻菌纲和红藻门（Rhodophyta）原生生物中，我们发现了SmDNAV蛋白的同源物，这些同源物与相关序列存在关联（以整合或共同测序的形式）。因此，我们提出将SmDNAV作为巨型病毒纲、核质巨DNA病毒门内一个新目的模式成员，并暂命名该目为Ariadnavirales。Ariadnavirales成员已经丢失了大多数编码复制和转录系统组分的基因，而这些组分通常在核质巨DNA病毒中是保守的；这提示其基因组复制和表达可能已转变为依赖宿主细胞核的过程。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.29.747986v1?rss=1

🏷️ 核质巨DNA病毒 Ariadnavirales目 巨病毒基因组 病毒进化 复制与转录系统丧失 宿主细胞核依赖