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基因组特征能够为受威胁种群的进化历史及其剩余适应潜力提供重要洞见。随着种群数量下降同时侵蚀遗传多样性及维持这种多样性的过程，了解现存变异的分布方式对于保护鹿角珊瑚（*Acropora cervicornis*）等物种变得愈发重要。鹿角珊瑚是加勒比地区珊瑚礁生态系统的基础构建者，但目前已极度濒危。我们对来自热带西大西洋10个地点的46个高覆盖度鹿角珊瑚基因组进行了分析，以评估其中性与适应性遗传结构、基因组多样性、种群历史、近交状况及连通性，并构建了一个区域性单倍型参考面板，以支持未来的基因组监测。 全基因组分析揭示了反复出现的区域性亚结构，但群体间分化程度较低，且部分可由距离隔离模式和有效迁移的空间变异解释。各亚种群具有相近水平的基因组多样性、共同的种群历史，以及有限的局地适应证据。这些模式支持将所采样的加勒比种群视为一个包含多个区域管理单元（MUs）的单一进化显著单元（ESU），而非彼此深度分化的进化谱系。尽管该物种保留了相当程度的遗传变异，且当前近交水平较低，但估算得到的当代有效种群大小较小，表明随着种群持续崩溃，其受到遗传漂变影响的脆弱性可能会增加；尤其是在隔离式管理进一步强化种群结构的情况下。总体而言，我们的研究结果强调，亟需采取能够保存并增强基因组多样性的干预措施，包括在风险可控的前提下开展辅助基因流动。依托本研究构建的单倍型参考面板，这些策略需要各区域相关机构开展协调合作，将鹿角珊瑚作为一个共同管理的单一进化显著单元加以保护和恢复。
基因组特征能够为受威胁种群的进化历史及其残存的适应潜力提供关键洞见。随着种群数量下降不断侵蚀遗传多样性及维持这种多样性的过程，了解现存变异的分布方式，对于保护鹿角珊瑚（Acropora cervicornis）等物种变得日益重要。鹿角珊瑚是加勒比地区珊瑚礁生态系统的基础构建者，但目前已处于极危状态。我们对来自热带西大西洋10个地点的46个高覆盖度鹿角珊瑚基因组进行了分析，以评估其中性与适应性遗传结构、基因组多样性、种群历史、近交程度和连通性，并构建了一个区域性单倍型参考面板，以支持未来的基因组监测。全基因组分析反复揭示出区域性亚结构，但分化程度较低，且部分可由距离隔离和有效迁移的空间变异解释。各亚种群具有相近水平的基因组多样性、共同的种群历史，并缺乏局地适应的充分证据。这些模式支持将所采样的加勒比种群视为一个单一的进化显著单元（evolutionarily significant unit，ESU），其中包含多个区域管理单元（management units，MUs），而非将其视为彼此深度分化的进化谱系。
尽管种群保留了相当程度的遗传变异，且当前近交水平较低，但估算的当代有效种群大小较小，这表明随着种群崩溃持续加剧，其受到遗传漂变影响的脆弱性可能不断上升，尤其是在隔离性管理进一步强化种群结构的情况下。总体而言，我们的研究结果强调，亟需采取能够保存并增强基因组多样性的干预措施，包括风险管理型辅助基因流动。在本文构建的单倍型参考面板支持下，这些策略需要各区域实体开展协调行动，以将鹿角珊瑚作为一个由多方共同管理的单一ESU进行保护与恢复。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.26.747420v1?rss=1
🏷️ 群体基因组学 遗传多样性 适应性分化 基因流动 珊瑚保护遗传学