珊瑚模式海葵Exaiptasia diaphana（Aiptasia）F003品系的基因组

我们展示了Aiptasia品系F003的基因组组装结果。F003是海葵及珊瑚模型生物Exaiptasia diaphana（刺胞动物门；珊瑚虫纲；六放珊瑚亚纲；海葵目；海葵科；Aiptasia）中广泛使用的实验室品系。该基因组组装总长度为237.34 Mb，包含12,480条重叠群（contigs），重叠群N50为76.47 kb；其中包括12,423条支架序列（scaffolds），支架N50为77.93 kb。此外，还组装获得了一个长度为19.79 kb、由单条重叠群构成的线粒体基因组。基于Metazoa数据集评估，该组装具有较高的完整性，BUSCO完整度为96.50%，其中单拷贝基因为94.80%，重复基因为1.70%，片段化基因为1.70%，缺失基因为1.80%。基因组注释共鉴定出29,589个蛋白质编码基因（包括2个假基因），重复序列含量为32.89%。雌性Aiptasia品系F003的基因组进一步提升了这一关键刺胞动物模型生物的研究价值，使研究人员能够在共生关系、微生物组和热胁迫研究中比较不同Aiptasia品系。由此，该基因组增强了Aiptasia作为模型生物的应用价值，有助于探究珊瑚全共生体功能、环境响应及其对环境变化的适应韧性机制。

我们 प्रस्तुत了海葵及珊瑚模型生物——Exaiptasia diaphana（刺胞动物门；珊瑚纲；六放珊瑚亚纲；海葵目；海葵科；Exaiptasia属）广泛使用的实验室品系 F003 的基因组组装结果。该基因组组装总长度为 237.34 Mb，分布于 12,480 个 contig 中，contig N50 为 76.47 kb（12,423 个 scaffold，scaffold N50 为 77.93 kb），其中包括一个长度为 19.79 kb、由单个 contig 组成的线粒体基因组。基于 metazoa 数据集评估，该组装具有较高的完整性，BUSCO 完整度为 96.50%，其中单拷贝基因为 94.80%，重复基因为 1.70%，片段化基因为 1.70%，缺失基因为 1.80%。基因组注释鉴定出 29,589 个蛋白质编码基因（包括 2 个假基因），重复序列含量为 32.89%。雌性海葵品系 F003 的基因组将有助于在共生关系、微生物组和热胁迫研究中比较不同 Aiptasia 品系，从而提升这一关键刺胞动物模型生物的应用价值。因此，该基因组进一步巩固了 Aiptasia 作为研究珊瑚全生物体功能、环境响应及其对环境变化适应韧性机制模型的价值。

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🏷️ Aiptasia F003 基因组组装 基因组注释 刺胞动物模型 珊瑚共生关系 热胁迫适应