所有可检测的古老全基因组复制事件均涉及杂交

全基因组加倍（whole-genome duplication，WGD），或称多倍化，是贯穿整个生命之树的一股重要进化力量。古老的WGD通常通过分析重复基因之间每个同义位点的同义替换数（dS）的分布来推断。在此，我们认为，对这些分布的标准解释并不完整。通过采用涵盖典型异源多倍体和同源多倍体系统的单倍型定相基因组组装结果，我们发现，dS主要在位于非重组染色体上的基因拷贝之间累积。因此，基于dS的WGD检测所依赖的并不仅仅是WGD本身，还取决于重复拷贝是否彼此独立地演化。这一区分将许多关于古老WGD的推断重新理解为杂交以及减数分裂隔离演化的信号，并改变了我们对多倍化在整个生命之树中的起源、可检测性及进化后果的认识。

全基因组复制（WGD），或称多倍化，是贯穿整个生命之树的一股重要进化力量。古老的全基因组复制通常根据重复基因之间同义替换数与同义位点数之比（d_S）的分布来推断。在此，我们认为，对这些分布的标准解释并不完整。通过分析涵盖典型自源多倍体和异源多倍体系统的单倍型分相基因组组装结果，我们发现，d_S 主要在非重组染色体上的基因拷贝之间累积。因此，基于 d_S 的全基因组复制检测并不仅仅取决于是否发生过全基因组复制，还取决于重复拷贝是否独立进化。这一区分重新诠释了许多关于古老全基因组复制的推断，将其视为杂交以及减数分裂隔离演化的信号，并改变了我们对多倍体在整个生命之树中的起源、可检测性及进化后果的理解。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.25.747000v1?rss=1

🏷️ 全基因组复制 多倍化 杂交 同义替换 基因组进化