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分泌蛋白在细胞内合成并被主动运输至细胞外,在发育、生理、免疫以及细胞间通信中发挥作用。在黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)中,许多分泌型信号通路在进化上是保守的,这使该物种成为研究人类发育、癌症、神经生物学和免疫调控的强有力模型。 为了构建果蝇分泌组,我们利用计算工具对所有果蝇蛋白质序列进行了系统分析,整合了 FlyBase、UniProt 和 Gene Ontology 的注释信息,并纳入了大规模蛋白质组学数据集。我们鉴定出 4,831 个编码推定分泌蛋白的基因,基于支持证据的类型和强度赋予其置信度评分,并建立了一个在线资源(www.flyrnai.org/apps/fly_secretome/)以供探索这些数据。与人类分泌组的比较显示,54% 的果蝇分泌组基因在人类基因组中具有保守同源物,而其中 83% 在人类中被注释为分泌型基因。此外,与果蝇单细胞转录组数据的比较表明,分泌蛋白比其他基因具有更强的组织特异性。最后,我们基于 Aging Fly Cell Atlas 的 snRNA-seq 数据集,分析了衰老过程中编码推定分泌蛋白的基因表达变化,从而展示了该资源的应用价值。
分泌蛋白在细胞内合成,并被主动转运至细胞外,在发育、生理、免疫以及细胞间通讯中发挥作用。在黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)中,许多分泌型信号通路在进化上是保守的,这使该物种成为研究人类发育、癌症、神经生物学和免疫调控的强大模型。
为了构建果蝇分泌组,我们利用计算工具对所有果蝇蛋白质序列进行了系统分析,整合了 FlyBase、UniProt 和 Gene Ontology 的注释,并纳入了大规模蛋白质组学数据集。我们鉴定出 4,831 个编码推定分泌蛋白的基因,根据支持证据的类型和强度赋予其置信度评分,并建立了一个在线资源(www.flyrnai.org/apps/fly_secretome/)以供探索这些数据。与人类分泌组的比较表明,果蝇分泌组基因中有 54% 在人类基因组中是保守的,而其中 83% 在人类中被注释为分泌型蛋白。此外,与果蝇单细胞转录组数据的比较显示,分泌蛋白比其他基因具有更强的组织特异性。最后,我们基于衰老果蝇细胞图谱(Aging Fly Cell Atlas)的 snRNA-seq 数据集,分析了衰老过程中编码推定分泌蛋白的基因表达变化,以展示该资源的实用性。
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.24.746765v1?rss=1
🏷️ 果蝇 分泌组 蛋白质组学 同源保守性 单细胞转录组 衰老