稻瘟病菌（Pyricularia oryzae）的出现与水稻的进化分化相吻合

稻瘟病由稻瘟病菌（Pyricularia oryzae）引起，是威胁全球水稻生产最具破坏性的病害之一。在已有充分文献记载的水稻传播历史背景下，重建P. oryzae的进化历史，为预测作物及其病原体的协同进化动态提供了有力框架。然而，由于缺乏化石证据，病原体起源及其进化时间尺度一直无法得到可靠估算。 在本研究中，我们利用源自水稻栽培起源与传播的考古学约束，推断了P. oryzae全基因组范围内的分化时间。我们的分析表明，P. oryzae大约起源于18,300年前，这一时间与栽培稻（Oryza sativa L.）从其祖先谱系中分化的时间相一致，而非与水稻驯化本身相对应。进一步以这一宿主分化事件对病原体的进化历史进行校准后，我们发现，基于核苷酸序列，P. oryzae于2,590年前到达日本列岛；基于氨基酸序列，则于3,030年前到达，二者均与考古学对日本稻作农业传入时间的估计高度吻合。 与目前普遍认为稻瘟病约于10,000年前随水稻驯化而出现的观点相反，我们的结果表明，P. oryzae起源于驯化之前，其后续传播则与栽培稻的扩张密切相关。这些发现重新界定了这一全球最重要作物病原体之一的进化历史，并为理解跨越数千年的作物—病原体协同进化建立了时间框架。

由稻瘟病菌（Pyricularia oryzae）引起的稻瘟病是威胁全球水稻生产最具破坏性的病害之一。在已有充分文献记载的水稻传播历史背景下，重建 P. oryzae 的进化史，为预测作物与其病原体之间的协同进化动态提供了有力框架。然而，由于缺乏化石证据，研究者一直无法对该病原体的起源及其进化时间尺度进行可靠估算。在本研究中，我们利用源自水稻栽培出现与传播的考古学约束，推断了 P. oryzae 的全基因组分化时间。我们的分析表明，P. oryzae 大约起源于 18,300 年前，这一时间与栽培稻（Oryza sativa L.）从其祖先谱系中分化相吻合，而非与水稻驯化本身同步。进一步以这一宿主分化事件校准该病原体的进化史后，我们发现，基于核苷酸序列推断，P. oryzae 于 2,590 年前到达日本列岛；基于氨基酸序列推断，则为 3,030 年前，这与考古学对水稻农业传入日本时间的估计高度一致。与当前普遍认为稻瘟病约在 10,000 年前随水稻驯化而出现的观点相反，我们的结果表明，P. oryzae 起源于驯化之前，而其后续传播则与栽培稻的扩张密切相关。这些发现重新界定了这一世界最重要作物病原体之一的进化历史，并为理解跨越数千年的作物—病原体协同进化建立了时间框架。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.24.746645v1?rss=1

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