SenSASP：一个统一的多层次衰老及SASP基因数据库

关于细胞衰老及衰老相关分泌表型（SASP）的研究依赖于独立整理的基因资源，而这些资源在覆盖范围、标识符体系和更新周期方面存在差异，使跨资源整合容易出错。我们将四个广泛使用的资源——CellAge、GenAge、SenMayo 特征集以及 Reactome 细胞衰老通路——统一到单一的标准标识符（Ensembl 基因 ID）之下，并为每个基因补充了四项输入资源均不具备的三层注释：跨物种保守性、组织和细胞类型表达，以及高置信度蛋白质-蛋白质相互作用。 在保留完整来源追踪信息的同时，统一过程将源条目总数 1,460 条整合为 1,250 个唯一基因（去除 210 条冗余条目，占 14.4%）；其中，173 个基因得到两个或以上资源的共同支持，2 个基因（IL6、JUN）得到全部四个资源的共同支持。三层注释分别覆盖了 95.8%、97.9% 和 93.0% 的基因，其中 89.4% 的基因同时具备全部三层注释。在随机抽取的 500 个标识符映射样本中，与 HGNC 和 Ensembl 的比对验证显示精确匹配率为 98.0%。 最终得到的 SenSASP 是一个单一、机器可读、可追踪来源的数据库，整合了标准化标识符以及新增的功能背景信息，并在本文中通过基因优先级评分和组织表达图谱加以展示。

关于细胞衰老及衰老相关分泌表型（SASP）的研究依赖于若干独立整理的基因资源，但这些资源在覆盖范围、标识符体系和更新周期方面存在差异，使跨资源整合容易出错。我们将四个被广泛使用的资源——CellAge、GenAge、SenMayo特征集以及Reactome细胞衰老通路——统一到单一的规范标识符（Ensembl基因ID）之上，并为每个基因补充了四个输入资源均不具备的三层注释信息：跨物种保守性、组织与细胞类型表达，以及高置信度蛋白质—蛋白质相互作用。

统一后，源条目总数由1,460条整合为1,250个唯一基因（去除210条冗余条目，占14.4%），同时完整保留了来源溯源信息：其中173个基因得到两个或以上资源的共同支持，2个基因（IL6、JUN）得到全部四个资源的共同支持。三层注释信息分别覆盖了95.8%、97.9%和93.0%的基因，其中89.4%的基因在三层注释中均有标注。在对500个基因的标识符映射进行随机抽样后，我们参照HGNC和Ensembl进行了验证，结果显示精确匹配率为98.0%。

最终形成的SenSASP是一个单一的、机器可读的、具备来源追踪能力的数据库，汇集了经过协调统一的标识符以及新增的功能背景信息，并在本文中通过基因优先级评分和组织表达图谱进行了展示。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.26.747427v1?rss=1

🏷️ 细胞衰老 SASP 基因数据库 Ensembl基因ID 多层注释 资源整合