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NKG2D（在人类中由 KLRK1 编码，在小鼠中由 Klrk1 编码）是一种由细胞毒性淋巴细胞表达的激活性受体。在人类中，NKG2D 信号传导受转录后水平调控：激活的 T 细胞保留 KLRK1 的内含子 4，生成 NKG2D-TR，一种截短的显性负性异构体，可限制受体信号传导。作为 NKG2D 靶向治疗的主要临床前模型，小鼠是否存在类似的调控机制尚不明确。我们分析了四个小鼠 RNA-seq 数据集，共 50 个样本，涵盖 T 细胞分化、移植物抗宿主病以及急性和慢性 LCMV 感染，重点考察了内含子保留异构体 Klrk1-203。该转录本保留了经典起始密码子，而其预测的终止密码子位于最后一个外显子的末端、最终外显子-外显子连接位点下游，提示其可能逃避无义介导的降解。如果被翻译，预测 Klrk1-203 将编码一种截短产物，保留胞质区和跨膜区，但缺失大部分配体结合胞外结构域。该预测结构与人类 NKG2D-TR 相似，尽管小鼠产物含有一段由所保留内含子编码的短 C 末端序列。Klrk1-203 在未受刺激的初始 T 细胞和早期效应 T 细胞中低于检测限，但在分化的效应和记忆细胞群中被诱导表达，在一个效应记忆样本中约占 Klrk1 总转录本的五分之一。基于读段的分析独立表明，随着分化内含子 4 保留水平增加；然而，短读长测序无法将 Klrk1-203 与同时保留内含子的 Klrk1-204 转录本完全区分，因此异构体特异性丰度依赖于基于模型的定量。另一种独立的编码潜能算法将 Klrk1-203 归类为非编码转录本，这对结构预测提供了重要的反向证据。总体而言，这些发现表明 Klrk1-203 是小鼠 NKG2D 的一个候选 NMD 抵抗性、分化相关调控因子，也可能是人类 NKG2D-TR 的对应物，值得进一步实验验证。
NKG2D（在人类中由 KLRK1 编码，在小鼠中由 Klrk1 编码）是一种由细胞毒性淋巴细胞表达的激活性受体。在人类中，NKG2D 信号在转录后水平受到调控：激活的 T 细胞保留 KLRK1 的第 4 号内含子，生成 NKG2D-TR，这是一种截短的显性负性同工型，可限制受体信号传导。作为 NKG2D 靶向疗法的主要临床前模型，小鼠是否具有类似的调控机制仍然未知。我们分析了四个小鼠 RNA-seq 数据集，共计 50 个样本，涵盖 T 细胞分化、移植物抗宿主病以及急性和慢性 LCMV 感染，考察了保留内含子同工型 Klrk1-203。该转录本保留了经典起始密码子，而其预测终止密码子位于最后一个外显子内、且在最终外显子-外显子连接位点下游，提示其可能逃避无义介导的降解。如果被翻译，Klrk1-203 预计编码一种截短产物，保留胞质区和跨膜区，但缺失大部分配体结合胞外结构域。该预测结构与人类 NKG2D-TR 相似，尽管小鼠产物包含一段由保留内含子编码的短 C 端序列。Klrk1-203 在未经刺激的初始 T 细胞和早期效应 T 细胞中低于检测限，但在分化的效应和记忆群体中被诱导，在一个效应记忆样本中约占总 Klrk1 转录本的五分之一。逐读层面的分析独立证实了随着分化内含子 4 保留增加；然而，短读长测序无法将 Klrk1-203 与共保留的 Klrk1-204 转录本完全区分，因此同工型特异性的丰度依赖于基于模型的定量。另一种独立的编码潜能算法将 Klrk1-203 归类为非编码转录本，为结构预测提供了重要的对照。综上，这些发现将 Klrk1-203 确定为小鼠 NKG2D 的一个候选 NMD 抗性、分化相关调控因子，并可能是人类 NKG2D-TR 的对应物，值得进一步实验验证。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.21.746301v1?rss=1
🏷️ 内含子保留 Klrk1 NKG2D-TR T细胞分化 转录后调控