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背景：炎症和肿瘤免疫微环境促进肺腺癌（LUAD）的进展，但炎症相关转录异质性、患者生存及免疫状态变异之间的关系尚未被充分界定。 目的：我们旨在鉴定炎症相关的LUAD亚型，构建一个简约的生存分层特征，并在公开转录组队列中表征其免疫和通路背景。 方法：表达谱和临床数据来源于TCGA-LUAD、GTEx正常肺组织以及GEO数据集GSE11969、GSE30219、GSE31210和GSE40791。采用包含596个炎症相关基因的整理基因集进行一致性聚类。整合差异表达分析、功能富集分析、单因素Cox回归和LASSO-Cox建模以构建基因表达风险评分。预后数据集包含730例病例，并随机分为训练集（n=502）和内部验证集（n=228）；85例GSE30219病例构成外部验证队列。采用免疫细胞富集分析、基因集富集分析（GSEA）、基因集变异分析（GSVA）和泛癌分析进行生物学背景诠释。 结果：LUAD与对照组比较鉴定出1,305个差异表达基因，其中498个上调、807个下调。一致性聚类解析出两个炎症相关亚型和67个亚型相关基因，其中相较于Cluster 2，Cluster 1中有64个基因表达更高、3个基因表达更低。肿瘤-对照比较与亚型比较之间有33个基因重叠。LASSO-Cox回归筛选出CHRDL1、FDCSP、CXCL13、CYP4B1和S100P。训练集中1年、3年和5年时间依赖性受试者工作特征曲线下面积分别为0.6625、0.6581和0.6658；内部验证集中分别为0.7422、0.6537和0.6761；外部验证集中分别为0.6560、0.6387和0.6753。不同风险组在多种T细胞、B细胞、自然杀伤细胞、髓系细胞、树突状细胞、巨噬细胞和粒细胞特征上存在差异。GSEA的正向富集信号包括细胞周期（标准化富集分数[NES]=2.67；校正后P=1.42 × 10^-）、DNA复制（NES=2.52；校正后P=2.52 × 10^-）、以及错配修复（NES=2.20；校正后P=1.77 × 10^-）。 结论：该五基因表达评分能够区分LUAD患者的生存分组，并捕捉协调性的增殖及免疫转录状态。其适度的判别能力支持开展进一步的生物学和临床验证，而非立即应用于临床。
背景：炎症和肿瘤免疫微环境促进肺腺癌（LUAD）的进展，但炎症相关转录异质性、患者生存与免疫状态变异三者之间的关系尚未得到充分阐明。 目的：我们旨在识别炎症相关的LUAD亚型，构建一个简约的生存分层特征，并在公开转录组队列中表征其免疫和通路背景。 方法：表达谱和临床数据来源于TCGA-LUAD、GTEx正常肺组织以及GEO数据集GSE11969、GSE30219、GSE31210和GSE40791。采用包含596个炎症相关基因的整理基因集进行一致性聚类。整合差异表达分析、功能富集分析、单因素Cox回归和LASSO-Cox建模，以构建基因表达风险评分。预后数据集包含730例病例，并随机分为训练集（n=502）和内部验证集（n=228）；GSE30219中的85例病例构成外部验证队列。采用免疫细胞富集分析、基因集富集分析（GSEA）、基因集变异分析（GSVA）和泛癌分析进行生物学背景诠释。 结果：LUAD与对照组比较共鉴定出1,305个差异表达基因，其中498个上调、807个下调。一致性聚类解析出两个炎症相关亚型和67个亚型相关基因，其中相较于Cluster 2，Cluster 1中有64个基因表达更高、3个基因表达更低。肿瘤-对照比较与亚型比较之间共有33个重叠基因。LASSO-Cox回归筛选出CHRDL1、FDCSP、CXCL13、CYP4B1和S100P。在训练集中，1年、3年和5年时间依赖性受试者工作特征曲线下面积分别为0.6625、0.6581和0.6658；在内部验证集中分别为0.7422、0.6537和0.6761；在外部验证集中分别为0.6560、0.6387和0.6753。不同风险组在多种T细胞、B细胞、自然杀伤细胞、髓系细胞、树突状细胞、巨噬细胞和粒细胞特征上存在差异。GSEA阳性信号包括细胞周期（标准化富集分数[NES]=2.67；校正P=1.42 x 10-）、DNA复制（NES=2.52；校正P=2.52 x 10-）和错配修复（NES=2.20；校正P=1.77 x 10-）。 结论：该五基因表达评分能够区分LUAD患者的生存分组，并捕捉协调一致的增殖性和免疫性转录状态。其具有中等区分能力，提示仍需进一步开展生物学和临床验证，而非立即应用于临床。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.21.746098v1?rss=1
🏷️ 肺腺癌 炎症相关基因特征 预后分层 肿瘤免疫微环境 LASSO-Cox模型