XRCC1促进DNA聚合酶β对DNA损伤的高效局部搜索

root 提交于 周三, 08/26/2026 - 02:47
氧化性DNA损伤是基因组完整性的常见威胁,其来源包括内源性代谢过程和环境暴露。若未得到修复,此类氧化性DNA损伤会促进诱变和基因组不稳定性。细胞通过碱基切除修复(BER)来应对此类损伤;BER是一条多步骤通路,需要多种蛋白质的协调作用。在BER中起核心作用的DNA聚合酶β(pol β)负责定位单核苷酸(1-nt)缺口并插入正确的核苷酸,而X射线修复交叉互补蛋白1(XRCC1)是一种支架蛋白,可与pol β形成稳定复合物,从而在DNA损伤位点协调BER因子的组装。XRCC1能够提高BER效率,但其发挥这一作用的机制尚不清楚。已有研究提出,pol β可能通过与未受损DNA的扫描相互作用被招募至DNA损伤位点,但这种行为迄今尚未被直接观察到。此外,其他BER蛋白,尤其是XRCC1,对pol β募集的影响仍不明确。在本研究中,我们利用相关性光镊-荧光显微镜技术,对pol β和XRCC1的DNA搜索及损伤识别过程进行了可视化。我们分别表征了各因子的单独行为,考察了它们作为pol β-XRCC1复合物时的行为,并评估了其与无嘌呤/无嘧啶核酸内切酶1(APE1)——即BER中位于pol β上游的酶——之间的相互作用。我们发现,pol β通过三维扩散定位损伤,而XRCC1则同时表现出三维扩散和一维扩散。两者结合时,XRCC1显著促使pol β的搜索方式转向一维扩散,从而能够利用这两种搜索机制对未受损DNA进行探查。当APE1和pol β同时存在时,pol β-1nt缺口复合物高度稳定,APE1在很大程度上无法解离已结合于损伤位点的pol β。综上,这些发现表明,XRCC1能够重塑pol β的搜索行为,从而促进高效的局部损伤识别,并为阐明BER因子如何协调损伤检测与加工以维持基因组稳定性提供了机制基础。

bfreudenthal{at}kumc.edu

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摘要 氧化性 DNA 损伤是基因组完整性面临的常见威胁,来源于内源性代谢过程和环境暴露。若未被修复,这类氧化性 DNA 损伤会促进突变发生和基因组不稳定性。细胞通过碱基切除修复(BER)来应对此类损伤;BER 是一条多步骤通路,需要多种蛋白质的协调作用。在 BER 中,DNA 聚合酶 β(pol β)处于核心地位,其负责定位单核苷酸(1-nt)缺口并插入正确的核苷酸;而 X 射线修复交叉互补蛋白 1(XRCC1)则是一种支架蛋白,可与 pol β 形成稳定复合物,以在 DNA 损伤位点协调 BER 因子。XRCC1 可提高 BER 效率,但其实现这一作用的机制尚不清楚。已有研究提出,pol β 可能通过与未受损 DNA 的扫描相互作用被招募至 DNA 损伤位点,但这一行为迄今尚未被直接观察到。此外,其他 BER 蛋白对 pol β 招募的影响,尤其是 XRCC1 的作用,仍不明确。在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本作品依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 提供。

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发布于 2026 年 8 月 25 日。

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Spencer Thompson, Kaitlin M DeHart, Matthew Schaich, Bret D Freudenthal

bioRxiv 2026.08.24.746741; doi: https://doi.org/10.64898/2026.08.24.746741

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Spencer Thompson, Kaitlin M DeHart, Matthew Schaich, Bret D Freudenthal

bioRxiv 2026.08.24.746741; doi: https://doi.org/10.64898/2026.08.24.746741


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