T细胞受体库多样性测量；基于动力系统模型的推断，T细胞受体库的傅里叶分析

T细胞库测序揭示了构成人体免疫应答的庞大而复杂的T细胞谱系。传统分析方法无法充分表征和定量构成T细胞库的T细胞受体多样性。以T细胞受体β链（TRB）V基因片段的使用情况衡量的T细胞受体克隆频率，当按其在TRB位点上的相应V基因片段位置排列时，在TRB基因组位点的空间域中呈现出周期性的波动曲线。以TRB-D1片段至TRB-V1-29片段之间的基因组距离为基础，采用Lomb-Scargle周期图进行傅里叶分析，并利用多种分析软件获得谱功率曲线，以量化来自6名异基因造血干细胞移植供者（基线）及受者（> / =100天）的TRB V克隆频率。谱功率曲线显示，6名供者中存在4–9 kb（113–252 millicycles/kb）范围内的主导谱峰，且频率域谱模式一致。这与健康个体中V片段的相似使用情况相一致。相比之下，受者显示出更为分散的谱，其谱质心相较供者向更高频率偏移（260 vs. 247 millicycles/kb）。与此观察一致，受者的低频指数更低（0.18 vs 0.20）。两组中功率均主要集中于

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🏷️ T细胞受体库 TRB多样性 傅里叶分析 Lomb-Scargle周期图 克隆频率