连续组织场塑造胰腺癌中的免疫组成

胰腺导管腺癌（PDAC）的空间组织通常通过将组织划分为富集特定细胞类型的离散邻域来描述，其中包括肌成纤维细胞样癌相关成纤维细胞（myCAF）。然而，这种组织形式是否也以连续空间场的形式延伸至整个组织，尚不明确。利用来自三个 Visium 队列的空间转录组数据以及一个独立的单细胞成像数据集，我们发现，myCAF 形成了在毫米尺度上具有连贯性的广泛空间场。免疫组成沿这些空间场呈连续变化：随着 myCAF 丰度增加，浸润细胞由细胞毒性 T 细胞和肥大细胞逐渐转向 SPP1 巨噬细胞、单核细胞和中性粒细胞，且不同免疫状态之间不存在明显边界。在一个包含 39 名供体的独立队列中，这五类细胞群均朝相同方向发生变化，其中三类相对于空间零模型仍具有显著性。一个在一定程度上独立的上皮细胞丰度空间场也与免疫组成呈相同方向的关联，表明仅凭基质结构无法解释免疫组织模式。 单细胞空间数据揭示了肿瘤上皮内部另一种连续组织形式。基底样特征与经典型特征构成单峰连续谱，大多数肿瘤细胞处于中间状态，且单个结构跨越该连续谱的较大范围。基底样特征在肿瘤—基质界面处最为显著，并随着与最近 myCAF 距离的增加而逐渐降低。综上，这些发现确定了 PDAC 中两个不同尺度上的连续空间组织：毫米尺度上的免疫组成变化，以及单细胞接触尺度上的肿瘤身份变化；而将组织划分为离散邻域的方式无法捕捉这些特征。

胰腺导管腺癌（PDAC）的空间组织通常通过将组织划分为富集特定细胞类型的离散邻域来描述，其中包括肌成纤维细胞样癌相关成纤维细胞（myCAF）。然而，这种组织模式是否也以连续空间场的形式延伸至整个组织，尚不明确。利用来自三个 Visium 队列的空间转录组数据以及一个独立的单细胞成像数据集，我们发现，myCAF 形成了在毫米尺度上具有连贯性的广泛空间场。免疫细胞组成沿这些空间场呈连续变化：随着 myCAF 丰度增加，浸润细胞由细胞毒性 T 细胞和肥大细胞逐渐转变为 SPP1 巨噬细胞、单核细胞和中性粒细胞，且不同免疫状态之间未出现明显边界。在一个包含 39 名供者的独立队列中，这五类细胞群均沿相同方向发生变化，其中三类相对于空间零模型仍具有统计学显著性。一个与之部分独立的上皮细胞丰度空间场也与免疫组成呈相同方向的关联，表明单凭基质结构无法解释免疫组织模式。

单细胞空间数据揭示了肿瘤上皮内部的第二种连续组织形式。基底样特征与经典型特征构成单峰连续谱，大多数肿瘤细胞处于中间状态，且单个组织结构跨越该连续谱的很大范围。在肿瘤—基质界面处，基底样特征最为显著；随着与最近 myCAF 距离的增加，该特征逐渐降低。综上，这些发现确定了 PDAC 中两个不同尺度的连续空间组织特征：毫米尺度上的免疫组成变化，以及单细胞接触尺度上的肿瘤细胞身份变化；而将组织划分为离散邻域的方法无法捕捉这些特征。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.22.746444v1?rss=1

🏷️ 胰腺导管腺癌 空间转录组 肿瘤免疫微环境 肌成纤维细胞样癌相关成纤维细胞 单细胞空间成像 连续空间组织