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背景/目的：MS4A4A与M2样巨噬细胞状态相关，而MS4A基因簇可调节可溶性TREM2水平及阿尔茨海默病风险。我们探讨MS4A4A是否始终标记人类髓系激活的M2侧，以及AlphaFold是否支持一种假设中的MS4A4A-MS4A6A相互作用。方法：我们重新分析了四个公开的人类数据集：来自独立三供体队列的原代单核细胞来源巨噬细胞的bulk RNA-seq和ATAC-seq，以及健康肝脏和重症COVID-19血液的单细胞RNA-seq图谱。采用AlphaFold 3对MS4A4A及MS4A4A-MS4A6A复合物进行建模，并使用pLDDT、预测对齐误差和ipTM进行评估。结果：在全部三位供体中，M2（IL-4）巨噬细胞的MS4A4A均高于M1（IFN-gamma；+ LPS）巨噬细胞（log2倍数变化+2.68，校正P = 0.0013）。其启动子在M2中显示出最高的平均可及性。MS4A4A在肝脏中以巨噬细胞为富集，在血液中以单核细胞为富集；在76.7%的M2样肝巨噬细胞中可检测到，而在39.3%的M1样肝巨噬细胞中可检测到，差异主要由阳性细胞比例驱动。AlphaFold对四个跨膜螺旋进行了高置信度建模（平均pLDDT 83.1），但预测的MS4A4A-MS4A6A界面未得到支持（ipTM 0.59）。结论：在独立的转录组、染色质和单细胞数据集中，MS4A4A始终与人类髓系激活的M2侧相关。上述发现为相关性证据，而所提出的MS4A4A-MS4A6A界面仍是未经验证的结构假说。
背景/目的：MS4A4A与M2样巨噬细胞状态相关，而MS4A基因簇会调节可溶性TREM2水平及阿尔茨海默病风险。我们探究MS4A4A是否始终标记人类髓系活化的M2一侧，以及AlphaFold是否支持所提出的MS4A4A-MS4A6A相互作用。方法：我们重新分析了四个公开的人类数据集：来自独立三供体队列的原代单核细胞来源巨噬细胞的整体RNA-seq和ATAC-seq，以及健康肝脏和重症COVID-19血液的单细胞RNA-seq图谱。使用AlphaFold 3对MS4A4A及MS4A4A-MS4A6A复合物进行建模，并以pLDDT、预测对齐误差和ipTM进行评估。结果：在全部三位供体中，M2（IL-4）型巨噬细胞的MS4A4A表达均高于M1（IFN-γ；+LPS）型巨噬细胞（log2倍数变化+2.68，校正P = 0.0013）。其启动子在M2中的平均可及性最高。在肝脏中，MS4A4A富集于巨噬细胞；在血液中，富集于单核细胞。并且在76.7%的M2样肝巨噬细胞中可检测到MS4A4A，而M1样肝巨噬细胞仅为39.3%，这一差异主要由阳性细胞比例驱动。AlphaFold对四个跨膜螺旋的建模具有较高置信度（平均pLDDT 83.1），但所预测的MS4A4A-MS4A6A界面未得到支持（ipTM 0.59）。结论：在独立的转录组、染色质和单细胞数据集中，MS4A4A始终与人类髓系活化的M2一侧相关。该发现具有相关性，而所提出的MS4A4A-MS4A6A界面仍是一项未经验证的结构假说。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.19.745820v1?rss=1
🏷️ MS4A4A M2型巨噬细胞 髓系激活 单细胞转录组 AlphaFold结构预测