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摘要。引言:早产通过异质性的症状、严重程度及病因,导致围产期母婴健康不良结局。妊娠未满37周即分娩,可能源于针对妊娠并发症的医学指征性干预,也可能在无既往症状的情况下自发发生。早产后采集的胎盘组织与足月胎盘相比表现出差异性DNA甲基化,这可能反映妊娠期间的健康状况。目前,胎盘DNA在评估进行中妊娠健康方面的应用仍然有限,因为妊娠期间采集胎盘组织会增加感染和流产风险。妊娠期胎盘取样相关风险限制了DNA甲基化在临床早产预测中的应用。在妊娠期间评估早产风险,需要采用无创方法对胎盘DNA甲基化进行表征。 结果:我们采用游离甲基化DNA免疫沉淀测序(cfMeDIP-seq),对妊娠女性(n = 99)和非妊娠女性(n = 93)血浆中高甲基化游离DNA的全基因组DNA甲基化模式进行了定量分析。在每个样本中,我们以300 bp基因组窗口评估DNA甲基化状态,同时考察测序读段计数和计算得到的DNA绝对摩尔量。已知的胎盘高甲基化区域,包括RASSF1、STAT5A和ERG启动子,在妊娠样本中的检出几率显著增加,提示游离胎盘DNA富集。在所检测的536,444个300 bp窗口中,173,071个(32%)在妊娠血浆中显示出显著富集。线性模型鉴定出107,505个差异甲基化区域(DMRs),与后续被诊断为宫内生长受限(IUGR)的妊娠相关(n = 22)。Alu元件在这些DMRs中的代表性高于预期,而其他重复元件则表现为代表性不足。 讨论:这些结果表明,cfMeDIP-seq能够富集游离胎盘DNA,并表征并发IUGR妊娠的游离DNA甲基化特征。游离胎盘DNA的富集使得能够从母体血浆中无创分析胎盘DNA甲基化。在临床症状出现之前,于母体血浆中可检测到的表观遗传学特征可能有助于识别早产风险升高的妊娠。我们的研究结果进一步凸显了游离胎盘DNA在监测妊娠健康方面的潜力。
摘要。引言:早产通过异质性的症状、严重程度和病因,导致不良的围产期母婴健康结局。妊娠未满37周即分娩,可能源于因妊娠并发症而进行的医学指征性干预,也可能在此前无症状的情况下自发发生。早产后采集的胎盘组织与足月胎盘相比表现出差异性DNA甲基化,这可能提示妊娠期间的健康状况。目前,胎盘DNA在评估进行中妊娠健康方面的应用仍有限,因为在妊娠期间采集胎盘组织会增加感染和流产风险。妊娠期间胎盘取样相关的风险限制了DNA甲基化在临床早产预测中的应用。在妊娠期间评估早产风险需要采用无创方法来表征胎盘DNA甲基化。
结果:我们采用游离甲基化DNA免疫沉淀测序(cfMeDIP-seq),对孕妇(n = 99)和非孕女性(n = 93)血浆中高甲基化游离DNA的全基因组DNA甲基化模式进行了定量分析。在每个样本中,我们在300 bp的基因组窗口内评估DNA甲基化状态,同时考察测序读段计数和计算得到的DNA绝对摩尔量。已知的高甲基化胎盘区域,包括RASSF1、STAT5A和ERG启动子,在孕妇样本中显示出显著更高的检出优势比,提示游离胎盘DNA富集。在所检测的536,444个300 bp窗口中,有173,071个(32%)在孕妇血浆中表现出显著富集。线性模型鉴定出107,505个与后续被诊断为宫内生长受限(IUGR)妊娠相关的差异甲基化区域(DMRs)(n = 22)。Alu元件在这些DMRs中的代表性高于预期,而其他重复元件则表现出代表性不足。
讨论:这些结果表明,cfMeDIP-seq能够富集游离胎盘DNA,并表征并发IUGR妊娠的游离DNA甲基化特征。游离胎盘DNA的富集使得能够从母体血浆中无创描绘胎盘DNA甲基化谱。母体血浆中可检测的表观遗传学特征,可能在临床症状出现之前识别出早产风险升高的妊娠。我们的发现进一步凸显了游离胎盘DNA在监测妊娠健康方面的潜力。
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.17.745276v1?rss=1
🏷️ 胎盘游离DNA DNA甲基化 cfMeDIP-seq 宫内生长受限 早产预测 无创产前检测