尽管存在局部适应，基因流动和近期谱系殖民仍限制了遗传分化

诸如向新环境扩殖和基因流动等种群过程，从根本上塑造了基因组景观；它们通过改变遗传多样性与适应性响应之间的平衡，促进或限制选择的效率。尽管理论预测表明，选择的效力取决于物种的人口统计历史，但实证研究往往忽视这些约束，从而得出具有误导性的观察结果。在本研究中，我们首次为林蛙（Lithobates sylvaticus）提供了功能基因组注释，为理解该物种的适应能力提供了关键的基因组资源。基于该注释，我们考察了选择驱动分布于美国康涅狄格州东北部春池中的各林蛙种群发生基因组和表型分化的潜力。基因型×环境关联分析显示，一个离群位点（Rab28）的频率会对一个值得注意的湿地作出显著响应；该湿地的特点是林冠覆盖相对较低且面积较大。我们还发现，选择推动了不同林蛙种群之间胚胎发育的显著差异，其速率超过了中性遗传漂变所能导致的水平。这一选择的基因组特征以及显著的表型分化表明，即使在一个以相对近期扩殖且繁殖湿地之间存在大量连通性证据为特征的景观中，自然选择仍能够克服遗传漂变的作用。上述发现增进了我们对林蛙在微地理尺度上变异格局的理解。

诸如向新环境扩殖和基因流动等种群统计过程，从根本上塑造了基因组图景；它们通过改变遗传多样性与适应性响应之间的平衡，促进或限制选择作用的效率。尽管理论预测表明，选择的效能由物种的种群统计历史所决定，但实证研究往往忽视这些约束，从而得出误导性的观察结果。在本研究中，我们首次提出了林蛙（Lithobates sylvaticus）的功能基因组注释，为理解该物种的适应能力提供了关键的基因组资源。

基于该注释，我们考察了选择作用驱动美国康涅狄格州东北部春池间分布的不同种群发生基因组和表型分化的潜力。基因型×环境关联分析表明，一个离群位点（Rab28）的频率在某一处湿地中显著升高，而该湿地的显著特征是林冠覆盖率相对较低且面积较大。我们还发现，选择作用已驱动林蛙不同种群在胚胎发育方面产生显著差异，其速率超过中性遗传漂变所导致的变化。

这种选择作用的基因组信号，加之显著的表型分化，表明即使在一个以相对近期扩殖为特征且在繁殖湿地之间存在大量连通性证据的景观中，自然选择仍能够克服遗传漂变的影响。这些发现增进了我们对林蛙在微地理尺度上变异格局的理解。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.15.745018v1?rss=1

🏷️ 局部适应 基因流动 遗传分化 种群基因组学 基因型-环境关联 林蛙