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出芽酵母酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是研究细胞应激反应及其潜在机制调控的经典模式生物。尽管葡萄糖饥饿会从根本上改变基因调控和细胞行为,但不一致的剥夺方案常常会诱发显著的形态学伪影。这些非特异性变化会通过激活独立于真实葡萄糖信号传导机制的通路而干扰研究结果。此外,在无混杂条件下对葡萄糖饥饿进行全面转录组分析的研究仍然缺乏。因此,介导细胞适应葡萄糖饥饿的关键代谢调控因子缺失所产生的精确转录影响仍未得到界定。在本研究中,我们采用了一种优化的葡萄糖饥饿方案,即利用棉子糖置换处理,结果显示可诱导广泛的转录应激反应,同时经无标记成像证实,对细胞形态的影响极小。转录组分析揭示,急性葡萄糖剥夺会引发代谢调控、ATP 周转以及细胞间通讯的变化,推动细胞向氧化驱动型代谢转变。此外,我们还表征了 SNF12 和 SPT20 缺失突变体中的转录变化;这两者是已知的细胞代谢调控因子。结果显示出此前未被充分认识的转录保守性,部分模拟了葡萄糖饥饿反应。最后,我们鉴定出与囊泡货物和应激特异性表达相关的变化,这些变化涉及膜凹结构(eisosome)组分和细胞表面转运蛋白,而它们对于代谢适应至关重要。总体而言,该数据集为解析应激信号传导并推动新假说的提出提供了全面的转录组资源。
急性葡萄糖剥夺的转录响应揭示了 Snf12 和 Spt20 在应激期间代谢适应中的作用 | bioRxiv
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急性葡萄糖剥夺的转录响应揭示了 Snf12 和 Spt20 在应激期间代谢适应中的作用
Justas Stanislovas,Kamilla M Laidlaw,Katherine M Paine,Daniel Ghete,Sally R James,Zoe Ingold,Samantha Donninger,Alastair Droop,Amy Milburn,Chris MacDonald
doi: https://doi.org/10.64898/2026.08.17.745332
Justas Stanislovas 约克大学 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 公开提供。
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发布于 2026 年 8 月 18 日。
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Justas Stanislovas,Kamilla M Laidlaw,Katherine M Paine,Daniel Ghete,Sally R James,Zoe Ingold,Samantha Donninger,Alastair Droop,Amy Milburn,Chris MacDonald
bioRxiv 2026.08.17.745332; doi: https://doi.org/10.64898/2026.08.17.745332
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急性葡萄糖剥夺的转录响应揭示了 Snf12 和 Spt20 在应激期间代谢适应中的作用
Justas Stanislovas,Kamilla M Laidlaw,Katherine M Paine,Daniel Ghete,Sally R James,Zoe Ingold,Samantha Donninger,Alastair Droop,Amy Milburn,Chris MacDonald
bioRxiv 2026.08.17.745332; doi: https://doi.org/10.64898/2026.08.17.745332
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.17.745332v1?rss=1
🏷️ 酿酒酵母 葡萄糖饥饿 转录组分析 代谢适应 SNF12 SPT20